Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTNNA2P26232 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTNNA2P26232 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTNNA2P26232 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CTNNA2P26232 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTNNA2P26232 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTNNA2P26232 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTNNA2P26232 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CTNNA2P26232 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTNNA2P26232 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTNNA2P26232 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTNNA2P26232 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CTNNA2P26232 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTNNA2P26232 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTNNA2P26232 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTNNA2P26232 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTNNA2P26232 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTNNA2P26232 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTNNA2P26232 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTNNA2P26232 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTNNA2P26232 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CTNNA2P26232 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CTNNA2P26232 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CTNNA2P26232 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTNNA2P26232 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTNNA2P26232 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTNNA2P26232 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTNNA2P26232 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTNNA2P26232 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTNNA2P26232 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTNNA2P26232 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTNNA2P26232 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTNNA2P26232 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTNNA2P26232 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTNNA2P26232 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTNNA2P26232 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTNNA2P26232 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTNNA2P26232 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTNNA2P26232 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTNNA2P26232 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTNNA2P26232 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTNNA2P26232 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTNNA2P26232 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTNNA2P26232 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTNNA2P26232 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTNNA2P26232 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTNNA2P26232 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNNA2P26232 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNNA2P26232 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNNA2P26232 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNNA2P26232 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNNA2P26232 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNNA2P26232 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTNNA2P26232 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTNNA2P26232 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTNNA2P26232 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTNNA2P26232 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTNNA2P26232 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTNNA2P26232 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTNNA2P26232 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CTNNA2P26232 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CTNNA2P26232 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTNNA2P26232 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTNNA2P26232 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTNNA2P26232 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTNNA2P26232 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CTNNA2P26232 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTNNA2P26232 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTNNA2P26232 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTNNA2P26232 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTNNA2P26232 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTNNA2P26232 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTNNA2P26232 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTNNA2P26232 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTNNA2P26232 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTNNA2P26232 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CTNNA2P26232 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CTNNA2P26232 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTNNA2P26232 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTNNA2P26232 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CTNNA2P26232 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTNNA2P26232 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CTNNA2P26232 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTNNA2P26232 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTNNA2P26232 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTNNA2P26232 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTNNA2P26232 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTNNA2P26232 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTNNA2P26232 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTNNA2P26232 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTNNA2P26232 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTNNA2P26232 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTNNA2P26232 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTNNA2P26232 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CTNNA2P26232 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CTNNA2P26232 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTNNA2P26232 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CTNNA2P26232 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTNNA2P26232 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTNNA2P26232 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms