Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMA3P25788 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMA3P25788 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMA3P25788 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PSMA3P25788 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMA3P25788 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMA3P25788 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMA3P25788 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMA3P25788 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMA3P25788 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMA3P25788 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMA3P25788 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMA3P25788 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMA3P25788 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMA3P25788 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMA3P25788 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMA3P25788 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMA3P25788 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMA3P25788 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMA3P25788 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMA3P25788 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMA3P25788 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMA3P25788 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMA3P25788 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMA3P25788 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMA3P25788 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMA3P25788 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMA3P25788 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMA3P25788 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMA3P25788 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSMA3P25788 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSMA3P25788 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSMA3P25788 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSMA3P25788 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMA3P25788 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMA3P25788 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMA3P25788 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMA3P25788 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMA3P25788 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMA3P25788 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMA3P25788 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMA3P25788 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMA3P25788 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMA3P25788 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMA3P25788 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMA3P25788 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMA3P25788 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMA3P25788 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMA3P25788 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMA3P25788 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMA3P25788 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMA3P25788 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMA3P25788 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMA3P25788 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMA3P25788 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMA3P25788 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMA3P25788 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMA3P25788 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMA3P25788 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMA3P25788 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMA3P25788 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMA3P25788 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMA3P25788 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PSMA3P25788 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PSMA3P25788 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMA3P25788 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMA3P25788 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMA3P25788 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMA3P25788 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMA3P25788 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMA3P25788 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMA3P25788 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMA3P25788 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMA3P25788 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMA3P25788 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMA3P25788 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMA3P25788 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMA3P25788 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMA3P25788 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMA3P25788 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMA3P25788 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMA3P25788 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMA3P25788 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSMA3P25788 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSMA3P25788 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSMA3P25788 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSMA3P25788 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSMA3P25788 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMA3P25788 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMA3P25788 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMA3P25788 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMA3P25788 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMA3P25788 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMA3P25788 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMA3P25788 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMA3P25788 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMA3P25788 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMA3P25788 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMA3P25788 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMA3P25788 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms