Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDE6GP18545 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDE6GP18545 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDE6GP18545 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDE6GP18545 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDE6GP18545 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDE6GP18545 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDE6GP18545 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDE6GP18545 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PDE6GP18545 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PDE6GP18545 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6GP18545 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6GP18545 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6GP18545 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6GP18545 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6GP18545 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6GP18545 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6GP18545 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6GP18545 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6GP18545 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6GP18545 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDE6GP18545 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDE6GP18545 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDE6GP18545 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDE6GP18545 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDE6GP18545 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDE6GP18545 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDE6GP18545 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDE6GP18545 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE6GP18545 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE6GP18545 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE6GP18545 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE6GP18545 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE6GP18545 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE6GP18545 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE6GP18545 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE6GP18545 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE6GP18545 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE6GP18545 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE6GP18545 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE6GP18545 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE6GP18545 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE6GP18545 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE6GP18545 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE6GP18545 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE6GP18545 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE6GP18545 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE6GP18545 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE6GP18545 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE6GP18545 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE6GP18545 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE6GP18545 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE6GP18545 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE6GP18545 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE6GP18545 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE6GP18545 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE6GP18545 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE6GP18545 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE6GP18545 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE6GP18545 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6GP18545 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6GP18545 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6GP18545 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6GP18545 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6GP18545 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6GP18545 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6GP18545 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6GP18545 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6GP18545 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6GP18545 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6GP18545 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6GP18545 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6GP18545 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6GP18545 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6GP18545 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6GP18545 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6GP18545 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6GP18545 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6GP18545 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6GP18545 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6GP18545 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6GP18545 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6GP18545 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6GP18545 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6GP18545 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDE6GP18545 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDE6GP18545 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDE6GP18545 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDE6GP18545 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDE6GP18545 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDE6GP18545 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDE6GP18545 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDE6GP18545 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDE6GP18545 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDE6GP18545 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PDE6GP18545 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDE6GP18545 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDE6GP18545 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDE6GP18545 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDE6GP18545 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms