Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CAPN2P17655 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CAPN2P17655 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CAPN2P17655 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CAPN2P17655 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CAPN2P17655 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CAPN2P17655 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CAPN2P17655 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CAPN2P17655 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CAPN2P17655 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CAPN2P17655 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAPN2P17655 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAPN2P17655 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAPN2P17655 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAPN2P17655 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAPN2P17655 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAPN2P17655 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CAPN2P17655 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CAPN2P17655 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CAPN2P17655 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CAPN2P17655 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CAPN2P17655 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CAPN2P17655 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CAPN2P17655 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CAPN2P17655 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CAPN2P17655 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CAPN2P17655 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CAPN2P17655 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CAPN2P17655 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CAPN2P17655 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CAPN2P17655 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAPN2P17655 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CAPN2P17655 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAPN2P17655 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAPN2P17655 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CAPN2P17655 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAPN2P17655 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAPN2P17655 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAPN2P17655 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAPN2P17655 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CAPN2P17655 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAPN2P17655 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAPN2P17655 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAPN2P17655 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAPN2P17655 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CAPN2P17655 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CAPN2P17655 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CAPN2P17655 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CAPN2P17655 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CAPN2P17655 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CAPN2P17655 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CAPN2P17655 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CAPN2P17655 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CAPN2P17655 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CAPN2P17655 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CAPN2P17655 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAPN2P17655 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAPN2P17655 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAPN2P17655 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAPN2P17655 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAPN2P17655 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAPN2P17655 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CAPN2P17655 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAPN2P17655 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAPN2P17655 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAPN2P17655 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAPN2P17655 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAPN2P17655 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAPN2P17655 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAPN2P17655 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAPN2P17655 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAPN2P17655 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAPN2P17655 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAPN2P17655 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAPN2P17655 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAPN2P17655 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAPN2P17655 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CAPN2P17655 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAPN2P17655 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAPN2P17655 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAPN2P17655 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CAPN2P17655 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CAPN2P17655 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CAPN2P17655 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CAPN2P17655 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CAPN2P17655 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CAPN2P17655 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CAPN2P17655 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CAPN2P17655 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CAPN2P17655 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CAPN2P17655 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAPN2P17655 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAPN2P17655 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAPN2P17655 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAPN2P17655 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CAPN2P17655 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAPN2P17655 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAPN2P17655 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAPN2P17655 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAPN2P17655 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms