Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP2A2P16615 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP2A2P16615 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP2A2P16615 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP2A2P16615 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ATP2A2P16615 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP2A2P16615 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
ATP2A2P16615 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP2A2P16615 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP2A2P16615 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP2A2P16615 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP2A2P16615 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP2A2P16615 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP2A2P16615 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP2A2P16615 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP2A2P16615 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP2A2P16615 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP2A2P16615 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP2A2P16615 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP2A2P16615 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP2A2P16615 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP2A2P16615 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP2A2P16615 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
ATP2A2P16615 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP2A2P16615 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP2A2P16615 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP2A2P16615 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP2A2P16615 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP2A2P16615 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP2A2P16615 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP2A2P16615 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP2A2P16615 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP2A2P16615 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP2A2P16615 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP2A2P16615 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP2A2P16615 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP2A2P16615 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP2A2P16615 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP2A2P16615 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP2A2P16615 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP2A2P16615 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP2A2P16615 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP2A2P16615 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP2A2P16615 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP2A2P16615 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP2A2P16615 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP2A2P16615 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP2A2P16615 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP2A2P16615 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP2A2P16615 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP2A2P16615 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP2A2P16615 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP2A2P16615 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP2A2P16615 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP2A2P16615 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP2A2P16615 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP2A2P16615 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP2A2P16615 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP2A2P16615 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP2A2P16615 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP2A2P16615 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP2A2P16615 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP2A2P16615 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP2A2P16615 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP2A2P16615 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP2A2P16615 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP2A2P16615 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP2A2P16615 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP2A2P16615 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP2A2P16615 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP2A2P16615 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP2A2P16615 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP2A2P16615 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP2A2P16615 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP2A2P16615 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP2A2P16615 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP2A2P16615 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP2A2P16615 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP2A2P16615 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP2A2P16615 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP2A2P16615 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP2A2P16615 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP2A2P16615 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP2A2P16615 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP2A2P16615 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP2A2P16615 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP2A2P16615 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP2A2P16615 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP2A2P16615 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP2A2P16615 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP2A2P16615 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP2A2P16615 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP2A2P16615 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP2A2P16615 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP2A2P16615 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP2A2P16615 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP2A2P16615 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP2A2P16615 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP2A2P16615 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP2A2P16615 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms