Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ITGB4P16144 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ITGB4P16144 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ITGB4P16144 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ITGB4P16144 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ITGB4P16144 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
ITGB4P16144 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ITGB4P16144 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
ITGB4P16144 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ITGB4P16144 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
ITGB4P16144 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
ITGB4P16144 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
ITGB4P16144 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
ITGB4P16144 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC32.7■■■□□ 2.82
ITGB4P16144 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ITGB4P16144 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ITGB4P16144 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ITGB4P16144 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ITGB4P16144 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ITGB4P16144 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ITGB4P16144 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ITGB4P16144 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ITGB4P16144 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ITGB4P16144 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
ITGB4P16144 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
ITGB4P16144 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
ITGB4P16144 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
ITGB4P16144 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ITGB4P16144 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ITGB4P16144 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ITGB4P16144 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ITGB4P16144 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
ITGB4P16144 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ITGB4P16144 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ITGB4P16144 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ITGB4P16144 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
ITGB4P16144 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ITGB4P16144 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ITGB4P16144 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ITGB4P16144 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ITGB4P16144 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ITGB4P16144 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
ITGB4P16144 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ITGB4P16144 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ITGB4P16144 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
ITGB4P16144 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ITGB4P16144 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ITGB4P16144 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ITGB4P16144 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ITGB4P16144 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ITGB4P16144 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ITGB4P16144 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ITGB4P16144 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ITGB4P16144 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ITGB4P16144 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ITGB4P16144 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ITGB4P16144 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ITGB4P16144 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ITGB4P16144 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ITGB4P16144 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.81
ITGB4P16144 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ITGB4P16144 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ITGB4P16144 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ITGB4P16144 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
ITGB4P16144 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ITGB4P16144 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ITGB4P16144 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ITGB4P16144 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
ITGB4P16144 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
ITGB4P16144 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ITGB4P16144 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ITGB4P16144 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
ITGB4P16144 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC32.51■■■□□ 2.8
ITGB4P16144 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.8
ITGB4P16144 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
ITGB4P16144 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
ITGB4P16144 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
ITGB4P16144 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
ITGB4P16144 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ITGB4P16144 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ITGB4P16144 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ITGB4P16144 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ITGB4P16144 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ITGB4P16144 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ITGB4P16144 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ITGB4P16144 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ITGB4P16144 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
ITGB4P16144 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ITGB4P16144 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ITGB4P16144 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ITGB4P16144 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ITGB4P16144 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ITGB4P16144 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ITGB4P16144 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
ITGB4P16144 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ITGB4P16144 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ITGB4P16144 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ITGB4P16144 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ITGB4P16144 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ITGB4P16144 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 208.7 ms