Protein–RNA interactions for Protein: P11940

PABPC1, Polyadenylate-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1P11940 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PABPC1P11940 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PABPC1P11940 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PABPC1P11940 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PABPC1P11940 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PABPC1P11940 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PABPC1P11940 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PABPC1P11940 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PABPC1P11940 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PABPC1P11940 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PABPC1P11940 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PABPC1P11940 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PABPC1P11940 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PABPC1P11940 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PABPC1P11940 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PABPC1P11940 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PABPC1P11940 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PABPC1P11940 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PABPC1P11940 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PABPC1P11940 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PABPC1P11940 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PABPC1P11940 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PABPC1P11940 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PABPC1P11940 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PABPC1P11940 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PABPC1P11940 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PABPC1P11940 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PABPC1P11940 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PABPC1P11940 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PABPC1P11940 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PABPC1P11940 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PABPC1P11940 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PABPC1P11940 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PABPC1P11940 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PABPC1P11940 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PABPC1P11940 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PABPC1P11940 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PABPC1P11940 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PABPC1P11940 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PABPC1P11940 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PABPC1P11940 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PABPC1P11940 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PABPC1P11940 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PABPC1P11940 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PABPC1P11940 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PABPC1P11940 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PABPC1P11940 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PABPC1P11940 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PABPC1P11940 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PABPC1P11940 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PABPC1P11940 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PABPC1P11940 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PABPC1P11940 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PABPC1P11940 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PABPC1P11940 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PABPC1P11940 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PABPC1P11940 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PABPC1P11940 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PABPC1P11940 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PABPC1P11940 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PABPC1P11940 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PABPC1P11940 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PABPC1P11940 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PABPC1P11940 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PABPC1P11940 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PABPC1P11940 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PABPC1P11940 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PABPC1P11940 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PABPC1P11940 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PABPC1P11940 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PABPC1P11940 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PABPC1P11940 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PABPC1P11940 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PABPC1P11940 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PABPC1P11940 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PABPC1P11940 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PABPC1P11940 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PABPC1P11940 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PABPC1P11940 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PABPC1P11940 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PABPC1P11940 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PABPC1P11940 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PABPC1P11940 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PABPC1P11940 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PABPC1P11940 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PABPC1P11940 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PABPC1P11940 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PABPC1P11940 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PABPC1P11940 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PABPC1P11940 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PABPC1P11940 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PABPC1P11940 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PABPC1P11940 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PABPC1P11940 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PABPC1P11940 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PABPC1P11940 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PABPC1P11940 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PABPC1P11940 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PABPC1P11940 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PABPC1P11940 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms