Protein–RNA interactions for Protein: P11597

CETP, Cholesteryl ester transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CETPP11597 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CETPP11597 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CETPP11597 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CETPP11597 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CETPP11597 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CETPP11597 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CETPP11597 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CETPP11597 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CETPP11597 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CETPP11597 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CETPP11597 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CETPP11597 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CETPP11597 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CETPP11597 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CETPP11597 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CETPP11597 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CETPP11597 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CETPP11597 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CETPP11597 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CETPP11597 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CETPP11597 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CETPP11597 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CETPP11597 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CETPP11597 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CETPP11597 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CETPP11597 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CETPP11597 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CETPP11597 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CETPP11597 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CETPP11597 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CETPP11597 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CETPP11597 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CETPP11597 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CETPP11597 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CETPP11597 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CETPP11597 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CETPP11597 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CETPP11597 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CETPP11597 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CETPP11597 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CETPP11597 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CETPP11597 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CETPP11597 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CETPP11597 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CETPP11597 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CETPP11597 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CETPP11597 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CETPP11597 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CETPP11597 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CETPP11597 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CETPP11597 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CETPP11597 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CETPP11597 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CETPP11597 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CETPP11597 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CETPP11597 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CETPP11597 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CETPP11597 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CETPP11597 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CETPP11597 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CETPP11597 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CETPP11597 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CETPP11597 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CETPP11597 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CETPP11597 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CETPP11597 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CETPP11597 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CETPP11597 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CETPP11597 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CETPP11597 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CETPP11597 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CETPP11597 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CETPP11597 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CETPP11597 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CETPP11597 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CETPP11597 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CETPP11597 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CETPP11597 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CETPP11597 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CETPP11597 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CETPP11597 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CETPP11597 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CETPP11597 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CETPP11597 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CETPP11597 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CETPP11597 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CETPP11597 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CETPP11597 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CETPP11597 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CETPP11597 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CETPP11597 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CETPP11597 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CETPP11597 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CETPP11597 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CETPP11597 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CETPP11597 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CETPP11597 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CETPP11597 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CETPP11597 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CETPP11597 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms