Protein–RNA interactions for Protein: P09603

CSF1, Macrophage colony-stimulating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1P09603 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF1P09603 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSF1P09603 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSF1P09603 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSF1P09603 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CSF1P09603 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSF1P09603 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSF1P09603 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSF1P09603 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSF1P09603 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSF1P09603 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSF1P09603 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSF1P09603 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSF1P09603 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSF1P09603 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSF1P09603 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSF1P09603 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSF1P09603 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSF1P09603 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSF1P09603 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CSF1P09603 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CSF1P09603 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSF1P09603 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSF1P09603 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSF1P09603 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSF1P09603 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSF1P09603 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSF1P09603 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CSF1P09603 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CSF1P09603 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
CSF1P09603 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CSF1P09603 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CSF1P09603 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CSF1P09603 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSF1P09603 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CSF1P09603 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSF1P09603 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSF1P09603 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CSF1P09603 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSF1P09603 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSF1P09603 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSF1P09603 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CSF1P09603 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSF1P09603 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSF1P09603 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSF1P09603 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CSF1P09603 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CSF1P09603 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSF1P09603 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CSF1P09603 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSF1P09603 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSF1P09603 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSF1P09603 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSF1P09603 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CSF1P09603 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSF1P09603 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CSF1P09603 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CSF1P09603 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSF1P09603 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CSF1P09603 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSF1P09603 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CSF1P09603 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSF1P09603 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CSF1P09603 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CSF1P09603 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSF1P09603 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSF1P09603 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSF1P09603 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSF1P09603 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSF1P09603 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSF1P09603 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSF1P09603 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSF1P09603 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSF1P09603 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSF1P09603 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSF1P09603 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSF1P09603 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSF1P09603 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSF1P09603 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSF1P09603 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSF1P09603 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSF1P09603 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSF1P09603 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSF1P09603 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSF1P09603 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSF1P09603 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSF1P09603 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSF1P09603 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSF1P09603 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSF1P09603 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSF1P09603 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSF1P09603 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSF1P09603 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSF1P09603 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSF1P09603 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSF1P09603 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSF1P09603 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSF1P09603 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSF1P09603 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSF1P09603 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms