Protein–RNA interactions for Protein: P08648

ITGA5, Integrin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA5P08648 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA5P08648 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA5P08648 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA5P08648 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA5P08648 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA5P08648 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA5P08648 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA5P08648 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA5P08648 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA5P08648 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA5P08648 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA5P08648 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA5P08648 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA5P08648 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA5P08648 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA5P08648 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA5P08648 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA5P08648 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA5P08648 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA5P08648 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA5P08648 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA5P08648 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA5P08648 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA5P08648 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA5P08648 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA5P08648 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA5P08648 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA5P08648 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA5P08648 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA5P08648 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA5P08648 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA5P08648 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA5P08648 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA5P08648 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA5P08648 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA5P08648 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA5P08648 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA5P08648 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA5P08648 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA5P08648 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA5P08648 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA5P08648 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA5P08648 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA5P08648 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA5P08648 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA5P08648 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA5P08648 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA5P08648 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA5P08648 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA5P08648 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA5P08648 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA5P08648 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA5P08648 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA5P08648 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA5P08648 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA5P08648 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA5P08648 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ITGA5P08648 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ITGA5P08648 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ITGA5P08648 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA5P08648 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA5P08648 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA5P08648 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA5P08648 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA5P08648 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA5P08648 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA5P08648 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA5P08648 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA5P08648 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA5P08648 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA5P08648 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA5P08648 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA5P08648 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA5P08648 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA5P08648 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA5P08648 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA5P08648 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA5P08648 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA5P08648 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA5P08648 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA5P08648 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA5P08648 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA5P08648 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA5P08648 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA5P08648 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA5P08648 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA5P08648 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA5P08648 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA5P08648 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA5P08648 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA5P08648 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA5P08648 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA5P08648 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA5P08648 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA5P08648 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA5P08648 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA5P08648 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA5P08648 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGA5P08648 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGA5P08648 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms