Protein–RNA interactions for Protein: P08247

SYP, Synaptophysin, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPP08247 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYPP08247 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYPP08247 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYPP08247 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYPP08247 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SYPP08247 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYPP08247 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SYPP08247 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYPP08247 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYPP08247 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SYPP08247 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYPP08247 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYPP08247 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYPP08247 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYPP08247 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SYPP08247 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYPP08247 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYPP08247 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYPP08247 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYPP08247 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYPP08247 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYPP08247 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYPP08247 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYPP08247 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYPP08247 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYPP08247 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYPP08247 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYPP08247 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SYPP08247 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYPP08247 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYPP08247 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYPP08247 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYPP08247 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYPP08247 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYPP08247 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYPP08247 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYPP08247 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SYPP08247 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYPP08247 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYPP08247 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYPP08247 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYPP08247 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYPP08247 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYPP08247 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYPP08247 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYPP08247 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYPP08247 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYPP08247 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYPP08247 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYPP08247 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SYPP08247 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYPP08247 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYPP08247 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYPP08247 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYPP08247 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SYPP08247 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYPP08247 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYPP08247 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYPP08247 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SYPP08247 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYPP08247 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYPP08247 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYPP08247 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYPP08247 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYPP08247 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYPP08247 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYPP08247 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYPP08247 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYPP08247 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYPP08247 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SYPP08247 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYPP08247 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYPP08247 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYPP08247 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SYPP08247 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYPP08247 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYPP08247 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SYPP08247 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SYPP08247 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYPP08247 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYPP08247 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYPP08247 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SYPP08247 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYPP08247 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SYPP08247 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYPP08247 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYPP08247 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYPP08247 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYPP08247 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SYPP08247 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYPP08247 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYPP08247 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYPP08247 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SYPP08247 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYPP08247 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYPP08247 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYPP08247 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYPP08247 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYPP08247 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYPP08247 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms