Protein–RNA interactions for Protein: P06493

CDK1, Cyclin-dependent kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK1P06493 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK1P06493 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK1P06493 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK1P06493 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK1P06493 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK1P06493 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK1P06493 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK1P06493 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK1P06493 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK1P06493 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK1P06493 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK1P06493 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK1P06493 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK1P06493 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK1P06493 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK1P06493 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK1P06493 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK1P06493 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK1P06493 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK1P06493 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK1P06493 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK1P06493 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK1P06493 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK1P06493 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK1P06493 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK1P06493 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK1P06493 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK1P06493 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK1P06493 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK1P06493 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK1P06493 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK1P06493 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK1P06493 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK1P06493 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK1P06493 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK1P06493 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK1P06493 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK1P06493 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK1P06493 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK1P06493 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK1P06493 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK1P06493 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK1P06493 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK1P06493 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK1P06493 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK1P06493 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK1P06493 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK1P06493 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK1P06493 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK1P06493 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK1P06493 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK1P06493 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK1P06493 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK1P06493 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK1P06493 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK1P06493 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK1P06493 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK1P06493 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK1P06493 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDK1P06493 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK1P06493 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK1P06493 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK1P06493 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK1P06493 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK1P06493 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK1P06493 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK1P06493 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK1P06493 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK1P06493 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK1P06493 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK1P06493 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK1P06493 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK1P06493 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK1P06493 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK1P06493 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK1P06493 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK1P06493 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK1P06493 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK1P06493 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK1P06493 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK1P06493 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK1P06493 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK1P06493 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK1P06493 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK1P06493 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK1P06493 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK1P06493 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK1P06493 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK1P06493 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK1P06493 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK1P06493 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK1P06493 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK1P06493 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK1P06493 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK1P06493 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK1P06493 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK1P06493 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK1P06493 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK1P06493 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK1P06493 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms