Protein–RNA interactions for Protein: P06307

CCK, Cholecystokinin, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKP06307 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKP06307 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKP06307 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKP06307 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKP06307 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKP06307 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKP06307 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKP06307 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKP06307 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKP06307 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKP06307 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCKP06307 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCKP06307 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCKP06307 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCKP06307 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCKP06307 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCKP06307 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKP06307 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKP06307 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKP06307 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKP06307 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKP06307 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKP06307 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKP06307 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKP06307 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKP06307 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKP06307 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKP06307 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKP06307 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKP06307 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKP06307 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKP06307 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKP06307 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKP06307 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKP06307 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKP06307 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKP06307 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKP06307 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKP06307 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKP06307 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKP06307 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKP06307 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKP06307 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKP06307 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKP06307 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKP06307 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKP06307 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKP06307 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKP06307 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKP06307 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKP06307 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKP06307 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKP06307 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKP06307 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKP06307 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKP06307 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKP06307 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKP06307 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKP06307 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKP06307 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKP06307 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKP06307 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKP06307 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKP06307 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCKP06307 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCKP06307 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCKP06307 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCKP06307 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCKP06307 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCKP06307 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCKP06307 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCKP06307 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CCKP06307 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CCKP06307 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKP06307 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKP06307 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKP06307 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKP06307 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKP06307 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKP06307 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKP06307 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKP06307 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKP06307 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKP06307 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKP06307 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKP06307 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKP06307 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKP06307 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKP06307 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKP06307 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKP06307 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKP06307 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKP06307 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKP06307 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKP06307 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKP06307 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKP06307 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKP06307 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKP06307 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKP06307 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms