Protein–RNA interactions for Protein: P05538

HLA-DQB2, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB2P05538 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HLA-DQB2P05538 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HLA-DQB2P05538 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HLA-DQB2P05538 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HLA-DQB2P05538 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HLA-DQB2P05538 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HLA-DQB2P05538 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HLA-DQB2P05538 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HLA-DQB2P05538 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HLA-DQB2P05538 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HLA-DQB2P05538 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HLA-DQB2P05538 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HLA-DQB2P05538 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HLA-DQB2P05538 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HLA-DQB2P05538 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HLA-DQB2P05538 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HLA-DQB2P05538 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HLA-DQB2P05538 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HLA-DQB2P05538 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-DQB2P05538 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-DQB2P05538 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-DQB2P05538 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-DQB2P05538 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-DQB2P05538 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-DQB2P05538 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-DQB2P05538 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-DQB2P05538 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-DQB2P05538 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-DQB2P05538 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HLA-DQB2P05538 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HLA-DQB2P05538 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HLA-DQB2P05538 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HLA-DQB2P05538 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HLA-DQB2P05538 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HLA-DQB2P05538 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HLA-DQB2P05538 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HLA-DQB2P05538 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HLA-DQB2P05538 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HLA-DQB2P05538 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HLA-DQB2P05538 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HLA-DQB2P05538 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HLA-DQB2P05538 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HLA-DQB2P05538 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HLA-DQB2P05538 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HLA-DQB2P05538 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HLA-DQB2P05538 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HLA-DQB2P05538 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HLA-DQB2P05538 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HLA-DQB2P05538 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HLA-DQB2P05538 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HLA-DQB2P05538 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HLA-DQB2P05538 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HLA-DQB2P05538 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
HLA-DQB2P05538 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HLA-DQB2P05538 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HLA-DQB2P05538 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HLA-DQB2P05538 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HLA-DQB2P05538 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HLA-DQB2P05538 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HLA-DQB2P05538 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HLA-DQB2P05538 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HLA-DQB2P05538 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HLA-DQB2P05538 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HLA-DQB2P05538 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HLA-DQB2P05538 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLA-DQB2P05538 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLA-DQB2P05538 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLA-DQB2P05538 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLA-DQB2P05538 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HLA-DQB2P05538 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HLA-DQB2P05538 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HLA-DQB2P05538 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HLA-DQB2P05538 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HLA-DQB2P05538 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HLA-DQB2P05538 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HLA-DQB2P05538 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HLA-DQB2P05538 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HLA-DQB2P05538 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HLA-DQB2P05538 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HLA-DQB2P05538 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HLA-DQB2P05538 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HLA-DQB2P05538 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLA-DQB2P05538 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLA-DQB2P05538 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLA-DQB2P05538 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HLA-DQB2P05538 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HLA-DQB2P05538 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HLA-DQB2P05538 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HLA-DQB2P05538 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HLA-DQB2P05538 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HLA-DQB2P05538 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HLA-DQB2P05538 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HLA-DQB2P05538 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HLA-DQB2P05538 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HLA-DQB2P05538 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-DQB2P05538 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-DQB2P05538 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-DQB2P05538 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-DQB2P05538 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-DQB2P05538 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 220.5 ms