Protein–RNA interactions for Protein: P04049

RAF1, RAF proto-oncogene serine/threonine-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAF1P04049 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAF1P04049 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAF1P04049 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RAF1P04049 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAF1P04049 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAF1P04049 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAF1P04049 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAF1P04049 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAF1P04049 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAF1P04049 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAF1P04049 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAF1P04049 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAF1P04049 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAF1P04049 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAF1P04049 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAF1P04049 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAF1P04049 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAF1P04049 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAF1P04049 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAF1P04049 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAF1P04049 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAF1P04049 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAF1P04049 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAF1P04049 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAF1P04049 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAF1P04049 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAF1P04049 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAF1P04049 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAF1P04049 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAF1P04049 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAF1P04049 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAF1P04049 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAF1P04049 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAF1P04049 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAF1P04049 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAF1P04049 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAF1P04049 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RAF1P04049 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAF1P04049 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAF1P04049 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAF1P04049 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAF1P04049 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAF1P04049 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAF1P04049 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAF1P04049 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAF1P04049 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAF1P04049 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAF1P04049 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAF1P04049 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAF1P04049 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAF1P04049 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAF1P04049 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAF1P04049 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAF1P04049 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAF1P04049 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAF1P04049 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAF1P04049 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAF1P04049 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAF1P04049 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAF1P04049 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAF1P04049 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAF1P04049 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAF1P04049 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAF1P04049 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAF1P04049 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAF1P04049 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAF1P04049 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAF1P04049 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAF1P04049 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAF1P04049 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAF1P04049 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAF1P04049 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAF1P04049 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAF1P04049 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAF1P04049 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAF1P04049 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAF1P04049 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAF1P04049 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAF1P04049 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RAF1P04049 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAF1P04049 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAF1P04049 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAF1P04049 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAF1P04049 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAF1P04049 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAF1P04049 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAF1P04049 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAF1P04049 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAF1P04049 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAF1P04049 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RAF1P04049 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAF1P04049 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAF1P04049 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAF1P04049 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAF1P04049 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAF1P04049 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAF1P04049 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAF1P04049 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RAF1P04049 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAF1P04049 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms