Protein–RNA interactions for Protein: P01891

HLA-A, HLA class I histocompatibility antigen, A-68 alpha chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-AP01891 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HLA-AP01891 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HLA-AP01891 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HLA-AP01891 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HLA-AP01891 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HLA-AP01891 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HLA-AP01891 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HLA-AP01891 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HLA-AP01891 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HLA-AP01891 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HLA-AP01891 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HLA-AP01891 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HLA-AP01891 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HLA-AP01891 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HLA-AP01891 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HLA-AP01891 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HLA-AP01891 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HLA-AP01891 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HLA-AP01891 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HLA-AP01891 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HLA-AP01891 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HLA-AP01891 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HLA-AP01891 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HLA-AP01891 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HLA-AP01891 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HLA-AP01891 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HLA-AP01891 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HLA-AP01891 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HLA-AP01891 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HLA-AP01891 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HLA-AP01891 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HLA-AP01891 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HLA-AP01891 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HLA-AP01891 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLA-AP01891 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLA-AP01891 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLA-AP01891 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLA-AP01891 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-AP01891 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-AP01891 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-AP01891 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-AP01891 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-AP01891 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-AP01891 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-AP01891 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-AP01891 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-AP01891 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-AP01891 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-AP01891 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-AP01891 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-AP01891 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-AP01891 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-AP01891 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-AP01891 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-AP01891 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-AP01891 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-AP01891 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-AP01891 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-AP01891 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-AP01891 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-AP01891 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-AP01891 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-AP01891 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-AP01891 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-AP01891 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-AP01891 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-AP01891 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-AP01891 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-AP01891 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-AP01891 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLA-AP01891 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HLA-AP01891 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLA-AP01891 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLA-AP01891 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLA-AP01891 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLA-AP01891 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLA-AP01891 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLA-AP01891 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLA-AP01891 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLA-AP01891 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLA-AP01891 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLA-AP01891 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLA-AP01891 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HLA-AP01891 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HLA-AP01891 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HLA-AP01891 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HLA-AP01891 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HLA-AP01891 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HLA-AP01891 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HLA-AP01891 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HLA-AP01891 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HLA-AP01891 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HLA-AP01891 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HLA-AP01891 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HLA-AP01891 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HLA-AP01891 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HLA-AP01891 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HLA-AP01891 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HLA-AP01891 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HLA-AP01891 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms