Protein–RNA interactions for Protein: O95922

TTLL1, Probable tubulin polyglutamylase TTLL1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1O95922 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TTLL1O95922 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TTLL1O95922 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TTLL1O95922 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TTLL1O95922 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TTLL1O95922 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
TTLL1O95922 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TTLL1O95922 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TTLL1O95922 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TTLL1O95922 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TTLL1O95922 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TTLL1O95922 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
TTLL1O95922 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TTLL1O95922 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TTLL1O95922 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TTLL1O95922 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TTLL1O95922 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TTLL1O95922 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TTLL1O95922 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TTLL1O95922 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TTLL1O95922 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TTLL1O95922 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TTLL1O95922 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
TTLL1O95922 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TTLL1O95922 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TTLL1O95922 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TTLL1O95922 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TTLL1O95922 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TTLL1O95922 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TTLL1O95922 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TTLL1O95922 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TTLL1O95922 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TTLL1O95922 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TTLL1O95922 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TTLL1O95922 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TTLL1O95922 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TTLL1O95922 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TTLL1O95922 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TTLL1O95922 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TTLL1O95922 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TTLL1O95922 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TTLL1O95922 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TTLL1O95922 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TTLL1O95922 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TTLL1O95922 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TTLL1O95922 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TTLL1O95922 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TTLL1O95922 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TTLL1O95922 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TTLL1O95922 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TTLL1O95922 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TTLL1O95922 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TTLL1O95922 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TTLL1O95922 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TTLL1O95922 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TTLL1O95922 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TTLL1O95922 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TTLL1O95922 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TTLL1O95922 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TTLL1O95922 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TTLL1O95922 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TTLL1O95922 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TTLL1O95922 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TTLL1O95922 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TTLL1O95922 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TTLL1O95922 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TTLL1O95922 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TTLL1O95922 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TTLL1O95922 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TTLL1O95922 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TTLL1O95922 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TTLL1O95922 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TTLL1O95922 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TTLL1O95922 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TTLL1O95922 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TTLL1O95922 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TTLL1O95922 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
TTLL1O95922 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TTLL1O95922 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TTLL1O95922 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TTLL1O95922 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
TTLL1O95922 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
TTLL1O95922 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TTLL1O95922 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TTLL1O95922 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TTLL1O95922 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TTLL1O95922 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TTLL1O95922 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TTLL1O95922 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TTLL1O95922 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TTLL1O95922 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TTLL1O95922 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TTLL1O95922 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TTLL1O95922 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TTLL1O95922 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TTLL1O95922 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TTLL1O95922 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TTLL1O95922 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TTLL1O95922 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TTLL1O95922 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms