Protein–RNA interactions for Protein: O95803

NDST3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST3O95803 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NDST3O95803 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NDST3O95803 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NDST3O95803 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NDST3O95803 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NDST3O95803 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NDST3O95803 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NDST3O95803 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NDST3O95803 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NDST3O95803 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NDST3O95803 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NDST3O95803 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NDST3O95803 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NDST3O95803 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NDST3O95803 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NDST3O95803 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NDST3O95803 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NDST3O95803 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NDST3O95803 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NDST3O95803 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NDST3O95803 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NDST3O95803 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NDST3O95803 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NDST3O95803 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NDST3O95803 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NDST3O95803 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NDST3O95803 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NDST3O95803 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NDST3O95803 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NDST3O95803 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NDST3O95803 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NDST3O95803 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NDST3O95803 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NDST3O95803 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NDST3O95803 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NDST3O95803 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NDST3O95803 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NDST3O95803 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NDST3O95803 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NDST3O95803 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NDST3O95803 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NDST3O95803 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NDST3O95803 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NDST3O95803 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NDST3O95803 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NDST3O95803 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NDST3O95803 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NDST3O95803 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NDST3O95803 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NDST3O95803 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NDST3O95803 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NDST3O95803 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NDST3O95803 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NDST3O95803 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NDST3O95803 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NDST3O95803 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NDST3O95803 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NDST3O95803 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NDST3O95803 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NDST3O95803 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NDST3O95803 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NDST3O95803 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NDST3O95803 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NDST3O95803 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NDST3O95803 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NDST3O95803 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NDST3O95803 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NDST3O95803 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NDST3O95803 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NDST3O95803 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NDST3O95803 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NDST3O95803 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NDST3O95803 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NDST3O95803 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NDST3O95803 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NDST3O95803 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NDST3O95803 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NDST3O95803 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NDST3O95803 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NDST3O95803 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NDST3O95803 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NDST3O95803 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NDST3O95803 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NDST3O95803 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NDST3O95803 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NDST3O95803 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NDST3O95803 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NDST3O95803 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NDST3O95803 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NDST3O95803 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NDST3O95803 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NDST3O95803 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NDST3O95803 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NDST3O95803 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NDST3O95803 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NDST3O95803 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NDST3O95803 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NDST3O95803 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NDST3O95803 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NDST3O95803 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms