Protein–RNA interactions for Protein: O94887

FARP2, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP2O94887 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
FARP2O94887 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FARP2O94887 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FARP2O94887 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FARP2O94887 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FARP2O94887 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FARP2O94887 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
FARP2O94887 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FARP2O94887 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FARP2O94887 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FARP2O94887 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
FARP2O94887 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
FARP2O94887 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FARP2O94887 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
FARP2O94887 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FARP2O94887 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FARP2O94887 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FARP2O94887 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FARP2O94887 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FARP2O94887 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
FARP2O94887 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
FARP2O94887 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FARP2O94887 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FARP2O94887 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FARP2O94887 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FARP2O94887 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FARP2O94887 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FARP2O94887 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FARP2O94887 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FARP2O94887 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
FARP2O94887 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FARP2O94887 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FARP2O94887 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FARP2O94887 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FARP2O94887 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FARP2O94887 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FARP2O94887 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
FARP2O94887 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FARP2O94887 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FARP2O94887 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FARP2O94887 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
FARP2O94887 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FARP2O94887 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FARP2O94887 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FARP2O94887 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FARP2O94887 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FARP2O94887 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FARP2O94887 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FARP2O94887 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FARP2O94887 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FARP2O94887 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
FARP2O94887 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FARP2O94887 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FARP2O94887 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FARP2O94887 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FARP2O94887 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FARP2O94887 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FARP2O94887 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FARP2O94887 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FARP2O94887 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FARP2O94887 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FARP2O94887 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
FARP2O94887 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
FARP2O94887 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FARP2O94887 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FARP2O94887 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
FARP2O94887 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FARP2O94887 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FARP2O94887 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FARP2O94887 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
FARP2O94887 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FARP2O94887 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FARP2O94887 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FARP2O94887 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FARP2O94887 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FARP2O94887 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
FARP2O94887 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FARP2O94887 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FARP2O94887 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FARP2O94887 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FARP2O94887 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FARP2O94887 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
FARP2O94887 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
FARP2O94887 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
FARP2O94887 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FARP2O94887 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FARP2O94887 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FARP2O94887 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FARP2O94887 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FARP2O94887 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FARP2O94887 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FARP2O94887 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FARP2O94887 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FARP2O94887 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FARP2O94887 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FARP2O94887 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FARP2O94887 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FARP2O94887 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FARP2O94887 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FARP2O94887 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms