Protein–RNA interactions for Protein: O75888

TNFSF13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13O75888 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF13O75888 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF13O75888 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF13O75888 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF13O75888 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFSF13O75888 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFSF13O75888 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFSF13O75888 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFSF13O75888 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFSF13O75888 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFSF13O75888 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFSF13O75888 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFSF13O75888 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFSF13O75888 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFSF13O75888 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF13O75888 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF13O75888 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF13O75888 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF13O75888 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF13O75888 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF13O75888 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF13O75888 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF13O75888 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFSF13O75888 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFSF13O75888 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFSF13O75888 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFSF13O75888 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNFSF13O75888 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF13O75888 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF13O75888 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF13O75888 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF13O75888 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF13O75888 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF13O75888 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF13O75888 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF13O75888 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF13O75888 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF13O75888 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF13O75888 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF13O75888 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFSF13O75888 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFSF13O75888 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFSF13O75888 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFSF13O75888 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFSF13O75888 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFSF13O75888 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFSF13O75888 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF13O75888 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF13O75888 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF13O75888 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF13O75888 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF13O75888 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF13O75888 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF13O75888 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF13O75888 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF13O75888 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF13O75888 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF13O75888 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF13O75888 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF13O75888 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF13O75888 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF13O75888 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF13O75888 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF13O75888 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF13O75888 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF13O75888 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF13O75888 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF13O75888 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF13O75888 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF13O75888 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF13O75888 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF13O75888 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF13O75888 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF13O75888 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF13O75888 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF13O75888 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF13O75888 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF13O75888 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF13O75888 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF13O75888 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF13O75888 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF13O75888 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF13O75888 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF13O75888 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF13O75888 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF13O75888 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF13O75888 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF13O75888 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF13O75888 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF13O75888 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF13O75888 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF13O75888 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF13O75888 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF13O75888 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF13O75888 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF13O75888 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF13O75888 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF13O75888 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF13O75888 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF13O75888 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms