Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NBNO60934 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NBNO60934 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NBNO60934 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NBNO60934 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NBNO60934 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NBNO60934 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NBNO60934 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NBNO60934 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NBNO60934 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NBNO60934 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NBNO60934 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NBNO60934 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NBNO60934 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NBNO60934 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NBNO60934 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NBNO60934 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NBNO60934 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NBNO60934 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NBNO60934 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NBNO60934 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NBNO60934 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NBNO60934 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NBNO60934 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NBNO60934 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NBNO60934 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NBNO60934 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NBNO60934 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NBNO60934 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NBNO60934 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NBNO60934 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NBNO60934 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NBNO60934 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NBNO60934 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NBNO60934 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NBNO60934 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NBNO60934 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NBNO60934 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NBNO60934 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NBNO60934 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NBNO60934 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NBNO60934 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NBNO60934 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NBNO60934 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NBNO60934 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NBNO60934 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NBNO60934 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NBNO60934 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NBNO60934 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NBNO60934 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NBNO60934 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NBNO60934 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NBNO60934 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NBNO60934 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NBNO60934 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NBNO60934 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NBNO60934 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NBNO60934 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NBNO60934 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NBNO60934 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NBNO60934 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NBNO60934 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NBNO60934 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NBNO60934 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NBNO60934 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NBNO60934 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NBNO60934 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NBNO60934 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NBNO60934 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NBNO60934 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NBNO60934 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NBNO60934 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NBNO60934 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NBNO60934 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NBNO60934 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NBNO60934 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
NBNO60934 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NBNO60934 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NBNO60934 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NBNO60934 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NBNO60934 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NBNO60934 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NBNO60934 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NBNO60934 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NBNO60934 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NBNO60934 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NBNO60934 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NBNO60934 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NBNO60934 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NBNO60934 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NBNO60934 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NBNO60934 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NBNO60934 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NBNO60934 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NBNO60934 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NBNO60934 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NBNO60934 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NBNO60934 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NBNO60934 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NBNO60934 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms