Protein–RNA interactions for Protein: O60279

SUSD5, Sushi domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD5O60279 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUSD5O60279 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUSD5O60279 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUSD5O60279 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUSD5O60279 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUSD5O60279 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUSD5O60279 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUSD5O60279 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUSD5O60279 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUSD5O60279 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SUSD5O60279 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD5O60279 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD5O60279 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD5O60279 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD5O60279 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUSD5O60279 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUSD5O60279 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUSD5O60279 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUSD5O60279 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SUSD5O60279 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUSD5O60279 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SUSD5O60279 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUSD5O60279 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUSD5O60279 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUSD5O60279 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUSD5O60279 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUSD5O60279 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUSD5O60279 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUSD5O60279 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUSD5O60279 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUSD5O60279 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUSD5O60279 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUSD5O60279 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUSD5O60279 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUSD5O60279 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUSD5O60279 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUSD5O60279 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms