Protein–RNA interactions for Protein: O43679

LDB2, LIM domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB2O43679 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LDB2O43679 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LDB2O43679 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LDB2O43679 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LDB2O43679 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LDB2O43679 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LDB2O43679 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LDB2O43679 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LDB2O43679 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LDB2O43679 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LDB2O43679 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LDB2O43679 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LDB2O43679 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LDB2O43679 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LDB2O43679 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LDB2O43679 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LDB2O43679 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LDB2O43679 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LDB2O43679 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LDB2O43679 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LDB2O43679 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LDB2O43679 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LDB2O43679 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LDB2O43679 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LDB2O43679 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LDB2O43679 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LDB2O43679 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LDB2O43679 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LDB2O43679 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LDB2O43679 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LDB2O43679 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LDB2O43679 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LDB2O43679 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LDB2O43679 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LDB2O43679 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LDB2O43679 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LDB2O43679 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LDB2O43679 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LDB2O43679 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LDB2O43679 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LDB2O43679 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LDB2O43679 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LDB2O43679 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LDB2O43679 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LDB2O43679 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LDB2O43679 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LDB2O43679 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LDB2O43679 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LDB2O43679 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LDB2O43679 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LDB2O43679 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LDB2O43679 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LDB2O43679 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LDB2O43679 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LDB2O43679 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LDB2O43679 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LDB2O43679 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LDB2O43679 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LDB2O43679 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LDB2O43679 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LDB2O43679 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LDB2O43679 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LDB2O43679 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LDB2O43679 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LDB2O43679 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LDB2O43679 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LDB2O43679 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDB2O43679 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDB2O43679 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDB2O43679 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDB2O43679 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDB2O43679 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDB2O43679 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDB2O43679 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDB2O43679 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDB2O43679 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDB2O43679 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDB2O43679 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDB2O43679 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LDB2O43679 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LDB2O43679 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LDB2O43679 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LDB2O43679 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDB2O43679 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDB2O43679 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDB2O43679 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDB2O43679 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDB2O43679 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDB2O43679 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDB2O43679 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LDB2O43679 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDB2O43679 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDB2O43679 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDB2O43679 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDB2O43679 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDB2O43679 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDB2O43679 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDB2O43679 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDB2O43679 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDB2O43679 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms