Protein–RNA interactions for Protein: O43474

KLF4, Krueppel-like factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF4O43474 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLF4O43474 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLF4O43474 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLF4O43474 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLF4O43474 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLF4O43474 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLF4O43474 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLF4O43474 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLF4O43474 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLF4O43474 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLF4O43474 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLF4O43474 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLF4O43474 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLF4O43474 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLF4O43474 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLF4O43474 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLF4O43474 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KLF4O43474 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLF4O43474 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLF4O43474 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLF4O43474 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLF4O43474 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLF4O43474 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLF4O43474 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLF4O43474 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLF4O43474 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLF4O43474 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLF4O43474 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLF4O43474 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLF4O43474 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLF4O43474 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLF4O43474 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLF4O43474 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLF4O43474 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLF4O43474 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLF4O43474 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLF4O43474 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLF4O43474 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLF4O43474 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLF4O43474 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLF4O43474 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLF4O43474 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLF4O43474 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLF4O43474 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLF4O43474 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KLF4O43474 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLF4O43474 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLF4O43474 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLF4O43474 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLF4O43474 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLF4O43474 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KLF4O43474 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLF4O43474 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLF4O43474 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLF4O43474 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLF4O43474 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLF4O43474 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLF4O43474 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLF4O43474 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KLF4O43474 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KLF4O43474 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KLF4O43474 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KLF4O43474 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KLF4O43474 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KLF4O43474 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KLF4O43474 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KLF4O43474 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KLF4O43474 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLF4O43474 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLF4O43474 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLF4O43474 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLF4O43474 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLF4O43474 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLF4O43474 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLF4O43474 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLF4O43474 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLF4O43474 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLF4O43474 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLF4O43474 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLF4O43474 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLF4O43474 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLF4O43474 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLF4O43474 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLF4O43474 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLF4O43474 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLF4O43474 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLF4O43474 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLF4O43474 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLF4O43474 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLF4O43474 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLF4O43474 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLF4O43474 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLF4O43474 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLF4O43474 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLF4O43474 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLF4O43474 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLF4O43474 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLF4O43474 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLF4O43474 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLF4O43474 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms