Protein–RNA interactions for Protein: O15198

SMAD9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD9O15198 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD9O15198 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD9O15198 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD9O15198 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD9O15198 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD9O15198 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD9O15198 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD9O15198 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD9O15198 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAD9O15198 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAD9O15198 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAD9O15198 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAD9O15198 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAD9O15198 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAD9O15198 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAD9O15198 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAD9O15198 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAD9O15198 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAD9O15198 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAD9O15198 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD9O15198 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD9O15198 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD9O15198 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD9O15198 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD9O15198 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD9O15198 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD9O15198 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD9O15198 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD9O15198 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD9O15198 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD9O15198 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD9O15198 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD9O15198 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD9O15198 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD9O15198 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD9O15198 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD9O15198 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD9O15198 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD9O15198 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD9O15198 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD9O15198 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD9O15198 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMAD9O15198 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMAD9O15198 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMAD9O15198 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMAD9O15198 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMAD9O15198 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMAD9O15198 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD9O15198 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD9O15198 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD9O15198 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD9O15198 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD9O15198 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD9O15198 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD9O15198 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD9O15198 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD9O15198 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD9O15198 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD9O15198 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD9O15198 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD9O15198 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD9O15198 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD9O15198 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD9O15198 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD9O15198 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD9O15198 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD9O15198 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD9O15198 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD9O15198 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD9O15198 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD9O15198 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD9O15198 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD9O15198 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD9O15198 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD9O15198 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD9O15198 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD9O15198 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD9O15198 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD9O15198 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD9O15198 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD9O15198 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMAD9O15198 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMAD9O15198 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMAD9O15198 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMAD9O15198 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMAD9O15198 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMAD9O15198 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMAD9O15198 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD9O15198 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD9O15198 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD9O15198 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMAD9O15198 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMAD9O15198 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMAD9O15198 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMAD9O15198 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMAD9O15198 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMAD9O15198 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD9O15198 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD9O15198 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD9O15198 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms