Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DFFAO00273 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DFFAO00273 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DFFAO00273 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DFFAO00273 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
DFFAO00273 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DFFAO00273 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DFFAO00273 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DFFAO00273 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DFFAO00273 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DFFAO00273 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DFFAO00273 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DFFAO00273 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DFFAO00273 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DFFAO00273 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DFFAO00273 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DFFAO00273 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DFFAO00273 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DFFAO00273 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DFFAO00273 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DFFAO00273 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DFFAO00273 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DFFAO00273 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DFFAO00273 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DFFAO00273 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DFFAO00273 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DFFAO00273 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DFFAO00273 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DFFAO00273 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DFFAO00273 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DFFAO00273 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DFFAO00273 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DFFAO00273 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DFFAO00273 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DFFAO00273 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DFFAO00273 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DFFAO00273 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
DFFAO00273 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
DFFAO00273 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
DFFAO00273 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DFFAO00273 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DFFAO00273 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DFFAO00273 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DFFAO00273 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DFFAO00273 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DFFAO00273 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DFFAO00273 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DFFAO00273 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DFFAO00273 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DFFAO00273 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DFFAO00273 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DFFAO00273 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DFFAO00273 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DFFAO00273 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DFFAO00273 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DFFAO00273 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DFFAO00273 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DFFAO00273 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DFFAO00273 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DFFAO00273 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DFFAO00273 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DFFAO00273 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DFFAO00273 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DFFAO00273 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DFFAO00273 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DFFAO00273 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DFFAO00273 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DFFAO00273 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DFFAO00273 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DFFAO00273 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DFFAO00273 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DFFAO00273 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DFFAO00273 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DFFAO00273 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DFFAO00273 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DFFAO00273 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DFFAO00273 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DFFAO00273 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
DFFAO00273 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DFFAO00273 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DFFAO00273 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DFFAO00273 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DFFAO00273 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DFFAO00273 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DFFAO00273 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
DFFAO00273 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DFFAO00273 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
DFFAO00273 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DFFAO00273 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DFFAO00273 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
DFFAO00273 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DFFAO00273 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DFFAO00273 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DFFAO00273 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DFFAO00273 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DFFAO00273 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DFFAO00273 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DFFAO00273 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DFFAO00273 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DFFAO00273 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms