Protein–RNA interactions for Protein: H7C350

CCDC188, Coiled-coil domain-containing protein 188, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC188H7C350 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC188H7C350 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC188H7C350 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC188H7C350 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC188H7C350 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC188H7C350 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC188H7C350 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC188H7C350 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC188H7C350 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC188H7C350 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC188H7C350 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC188H7C350 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC188H7C350 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC188H7C350 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC188H7C350 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC188H7C350 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC188H7C350 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC188H7C350 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC188H7C350 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC188H7C350 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC188H7C350 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC188H7C350 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC188H7C350 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC188H7C350 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC188H7C350 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC188H7C350 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC188H7C350 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC188H7C350 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC188H7C350 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC188H7C350 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC188H7C350 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC188H7C350 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC188H7C350 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC188H7C350 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC188H7C350 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC188H7C350 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC188H7C350 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC188H7C350 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC188H7C350 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC188H7C350 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC188H7C350 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC188H7C350 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC188H7C350 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC188H7C350 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC188H7C350 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC188H7C350 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC188H7C350 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC188H7C350 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC188H7C350 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC188H7C350 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC188H7C350 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC188H7C350 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC188H7C350 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC188H7C350 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC188H7C350 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC188H7C350 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC188H7C350 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC188H7C350 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC188H7C350 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC188H7C350 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC188H7C350 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC188H7C350 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC188H7C350 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC188H7C350 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC188H7C350 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC188H7C350 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC188H7C350 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC188H7C350 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC188H7C350 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC188H7C350 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC188H7C350 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC188H7C350 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC188H7C350 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC188H7C350 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC188H7C350 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC188H7C350 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC188H7C350 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC188H7C350 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC188H7C350 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC188H7C350 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC188H7C350 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC188H7C350 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC188H7C350 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC188H7C350 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC188H7C350 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC188H7C350 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC188H7C350 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC188H7C350 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC188H7C350 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC188H7C350 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC188H7C350 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC188H7C350 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC188H7C350 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC188H7C350 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC188H7C350 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC188H7C350 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC188H7C350 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC188H7C350 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC188H7C350 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC188H7C350 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms