Protein–RNA interactions for Protein: F8VUJ3

POC1B-GALNT4, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POC1B-GALNT4F8VUJ3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
POC1B-GALNT4F8VUJ3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POC1B-GALNT4F8VUJ3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
POC1B-GALNT4F8VUJ3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POC1B-GALNT4F8VUJ3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
POC1B-GALNT4F8VUJ3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POC1B-GALNT4F8VUJ3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POC1B-GALNT4F8VUJ3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POC1B-GALNT4F8VUJ3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POC1B-GALNT4F8VUJ3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POC1B-GALNT4F8VUJ3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POC1B-GALNT4F8VUJ3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POC1B-GALNT4F8VUJ3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POC1B-GALNT4F8VUJ3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms