Protein–RNA interactions for Protein: E9PIF3

NPIPA2, Nuclear pore complex-interacting protein family member A2, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA2E9PIF3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPIPA2E9PIF3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPIPA2E9PIF3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NPIPA2E9PIF3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPIPA2E9PIF3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPIPA2E9PIF3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPIPA2E9PIF3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NPIPA2E9PIF3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPIPA2E9PIF3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPIPA2E9PIF3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPIPA2E9PIF3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPIPA2E9PIF3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPIPA2E9PIF3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPIPA2E9PIF3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPIPA2E9PIF3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPIPA2E9PIF3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPIPA2E9PIF3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPIPA2E9PIF3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPIPA2E9PIF3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NPIPA2E9PIF3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPIPA2E9PIF3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPIPA2E9PIF3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPIPA2E9PIF3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPIPA2E9PIF3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NPIPA2E9PIF3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPIPA2E9PIF3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPIPA2E9PIF3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPIPA2E9PIF3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPIPA2E9PIF3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPIPA2E9PIF3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPIPA2E9PIF3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPIPA2E9PIF3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NPIPA2E9PIF3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPIPA2E9PIF3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPIPA2E9PIF3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPIPA2E9PIF3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPIPA2E9PIF3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPIPA2E9PIF3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPIPA2E9PIF3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPIPA2E9PIF3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPIPA2E9PIF3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPIPA2E9PIF3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NPIPA2E9PIF3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPIPA2E9PIF3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NPIPA2E9PIF3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPIPA2E9PIF3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPIPA2E9PIF3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPIPA2E9PIF3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPIPA2E9PIF3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPIPA2E9PIF3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPIPA2E9PIF3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPIPA2E9PIF3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPIPA2E9PIF3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPIPA2E9PIF3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPIPA2E9PIF3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NPIPA2E9PIF3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPIPA2E9PIF3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPA2E9PIF3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPA2E9PIF3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPA2E9PIF3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPA2E9PIF3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPA2E9PIF3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPA2E9PIF3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPA2E9PIF3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPA2E9PIF3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPIPA2E9PIF3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPIPA2E9PIF3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPIPA2E9PIF3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPIPA2E9PIF3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPIPA2E9PIF3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPIPA2E9PIF3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPIPA2E9PIF3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPIPA2E9PIF3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NPIPA2E9PIF3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPIPA2E9PIF3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPIPA2E9PIF3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPIPA2E9PIF3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPIPA2E9PIF3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPIPA2E9PIF3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NPIPA2E9PIF3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPIPA2E9PIF3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NPIPA2E9PIF3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPIPA2E9PIF3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPIPA2E9PIF3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPIPA2E9PIF3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NPIPA2E9PIF3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPIPA2E9PIF3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPIPA2E9PIF3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPIPA2E9PIF3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPIPA2E9PIF3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPIPA2E9PIF3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPIPA2E9PIF3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPIPA2E9PIF3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPIPA2E9PIF3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPIPA2E9PIF3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPIPA2E9PIF3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPIPA2E9PIF3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPIPA2E9PIF3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPIPA2E9PIF3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPIPA2E9PIF3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms