Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQJ5

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQJ5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
A0A1W2PQJ5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
A0A1W2PQJ5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
A0A1W2PQJ5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
A0A1W2PQJ5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
A0A1W2PQJ5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
A0A1W2PQJ5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
A0A1W2PQJ5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
A0A1W2PQJ5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
A0A1W2PQJ5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
A0A1W2PQJ5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
A0A1W2PQJ5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
A0A1W2PQJ5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A1W2PQJ5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A1W2PQJ5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A1W2PQJ5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A1W2PQJ5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
A0A1W2PQJ5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
A0A1W2PQJ5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
A0A1W2PQJ5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
A0A1W2PQJ5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
A0A1W2PQJ5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
A0A1W2PQJ5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
A0A1W2PQJ5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
A0A1W2PQJ5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
A0A1W2PQJ5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
A0A1W2PQJ5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
A0A1W2PQJ5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
A0A1W2PQJ5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
A0A1W2PQJ5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
A0A1W2PQJ5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
A0A1W2PQJ5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
A0A1W2PQJ5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
A0A1W2PQJ5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
A0A1W2PQJ5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
A0A1W2PQJ5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
A0A1W2PQJ5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
A0A1W2PQJ5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
A0A1W2PQJ5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
A0A1W2PQJ5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
A0A1W2PQJ5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
A0A1W2PQJ5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
A0A1W2PQJ5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
A0A1W2PQJ5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
A0A1W2PQJ5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
A0A1W2PQJ5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
A0A1W2PQJ5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
A0A1W2PQJ5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
A0A1W2PQJ5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
A0A1W2PQJ5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
A0A1W2PQJ5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
A0A1W2PQJ5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
A0A1W2PQJ5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
A0A1W2PQJ5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
A0A1W2PQJ5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
A0A1W2PQJ5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
A0A1W2PQJ5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A1W2PQJ5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A1W2PQJ5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A1W2PQJ5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A1W2PQJ5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A1W2PQJ5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A1W2PQJ5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
A0A1W2PQJ5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
A0A1W2PQJ5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
A0A1W2PQJ5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
A0A1W2PQJ5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
A0A1W2PQJ5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
A0A1W2PQJ5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
A0A1W2PQJ5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
A0A1W2PQJ5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
A0A1W2PQJ5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
A0A1W2PQJ5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
A0A1W2PQJ5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
A0A1W2PQJ5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A1W2PQJ5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A1W2PQJ5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A1W2PQJ5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A1W2PQJ5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
A0A1W2PQJ5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
A0A1W2PQJ5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
A0A1W2PQJ5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
A0A1W2PQJ5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
A0A1W2PQJ5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
A0A1W2PQJ5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
A0A1W2PQJ5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A1W2PQJ5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A1W2PQJ5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A1W2PQJ5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A1W2PQJ5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
A0A1W2PQJ5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
A0A1W2PQJ5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
A0A1W2PQJ5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
A0A1W2PQJ5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
A0A1W2PQJ5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
A0A1W2PQJ5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
A0A1W2PQJ5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
A0A1W2PQJ5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
A0A1W2PQJ5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
A0A1W2PQJ5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms