Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPC4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PPC4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A1W2PPC4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A1W2PPC4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
A0A1W2PPC4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A1W2PPC4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A1W2PPC4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A1W2PPC4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A1W2PPC4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A1W2PPC4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A1W2PPC4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A1W2PPC4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A1W2PPC4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A1W2PPC4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A1W2PPC4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A1W2PPC4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A1W2PPC4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A1W2PPC4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A1W2PPC4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A1W2PPC4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A1W2PPC4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A1W2PPC4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A1W2PPC4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A1W2PPC4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A1W2PPC4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A1W2PPC4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A1W2PPC4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A1W2PPC4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A1W2PPC4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A1W2PPC4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A1W2PPC4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A1W2PPC4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A1W2PPC4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A1W2PPC4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A1W2PPC4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A1W2PPC4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A1W2PPC4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A1W2PPC4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A1W2PPC4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A1W2PPC4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A1W2PPC4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A1W2PPC4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A1W2PPC4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A1W2PPC4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A1W2PPC4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A1W2PPC4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A1W2PPC4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A1W2PPC4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A1W2PPC4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A1W2PPC4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A1W2PPC4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A1W2PPC4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A1W2PPC4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A1W2PPC4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A1W2PPC4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A1W2PPC4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A1W2PPC4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A1W2PPC4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A1W2PPC4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A1W2PPC4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A1W2PPC4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A1W2PPC4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A1W2PPC4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A1W2PPC4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A1W2PPC4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A1W2PPC4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A1W2PPC4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A1W2PPC4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A1W2PPC4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A1W2PPC4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A1W2PPC4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A1W2PPC4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
A0A1W2PPC4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A1W2PPC4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A1W2PPC4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A1W2PPC4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A1W2PPC4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A1W2PPC4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A1W2PPC4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A1W2PPC4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A1W2PPC4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A1W2PPC4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A1W2PPC4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A1W2PPC4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A1W2PPC4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A1W2PPC4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A1W2PPC4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A1W2PPC4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A1W2PPC4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A1W2PPC4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A1W2PPC4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A1W2PPC4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A1W2PPC4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A1W2PPC4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A1W2PPC4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A1W2PPC4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A1W2PPC4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
A0A1W2PPC4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
A0A1W2PPC4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
A0A1W2PPC4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A1W2PPC4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms