Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.48e-7■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.198e-7■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.078e-7■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 MSMO1-205ENST00000507013 973 ntTSL 226.53■■□□□ 1.848e-7■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.669e-9■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 ST6GAL1-214ENST00000455441 596 ntTSL 425.29■■□□□ 1.648e-7■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 ST6GAL1-205ENST00000427315 544 ntTSL 425.14■■□□□ 1.628e-7■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 PIPOX-208ENST00000580241 1772 ntTSL 524.69■■□□□ 1.548e-7■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 PIPOX-209ENST00000580383 580 ntTSL 324.47■■□□□ 1.518e-7■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.486e-19■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 PIPOX-210ENST00000583215 1829 ntTSL 522.75■■□□□ 1.238e-7■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.989e-9■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.892e-11■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.862e-11■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.858e-7■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.788e-7■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.748e-7■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 PDXDC1-209ENST00000563667 554 ntTSL 419.14■□□□□ 0.652e-11■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 PTK7-216ENST00000489707 1935 ntTSL 1 (best)18.87■□□□□ 0.612e-11■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.569e-9■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.526e-19■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 PTK7-208ENST00000470019 4016 ntTSL 518.14■□□□□ 0.492e-11■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.486e-19■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 PTK7-207ENST00000461389 1035 ntTSL 217.95■□□□□ 0.462e-11■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 PTK7-201ENST00000230418 3958 ntTSL 1 (best)17.69■□□□□ 0.422e-11■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 PTK7-215ENST00000487673 5282 ntTSL 217.65■□□□□ 0.422e-11■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.352e-11■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.342e-11■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.318e-7■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 ZFHX4-AS1-201ENST00000518143 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.238e-7■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 ST6GAL1-216ENST00000458216 507 ntTSL 315.95■□□□□ 0.148e-7■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 PABPN1-205ENST00000555295 406 ntTSL 315.89■□□□□ 0.138e-7■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 PTK7-204ENST00000349241 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.132e-11■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 BCL2L2-PABPN1-201ENST00000553781 1241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.128e-7■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 PIPOX-204ENST00000469082 760 ntTSL 515.24■□□□□ 0.038e-7■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 GSN-205ENST00000373823 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.026e-19■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 PIPOX-205ENST00000484308 1038 ntTSL 314.77□□□□□ -0.058e-7■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 ST6GAL1-207ENST00000438590 608 ntTSL 314.76□□□□□ -0.058e-7■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 ZFHX4-AS1-204ENST00000522961 240 ntTSL 514.73□□□□□ -0.058e-7■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 FARP1-201ENST00000319562 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.079e-9■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 SRPRA-203ENST00000528744 856 ntTSL 214.28□□□□□ -0.128e-7■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 PDXDC1-211ENST00000565362 720 ntTSL 513.26□□□□□ -0.292e-11■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 PTK7-213ENST00000481273 3436 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.342e-11■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 SKIV2L-205ENST00000466290 583 ntTSL 312.5□□□□□ -0.418e-7■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 ST6GAL1-212ENST00000448408 1005 ntTSL 512.48□□□□□ -0.418e-7■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 CDK6-201ENST00000265734 11612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.449e-9■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 ST6GAL1-204ENST00000423451 602 ntTSL 412.02□□□□□ -0.498e-7■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 RAB3GAP1-201ENST00000264158 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.598e-7■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 RAB3GAP1-203ENST00000442034 4185 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.628e-7■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 ST6GAL1-210ENST00000446170 588 ntTSL 411.1□□□□□ -0.638e-7■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 RAD21-201ENST00000297338 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.688e-7■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 ST6GAL1-206ENST00000430309 504 ntTSL 410.71□□□□□ -0.698e-7■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 FARP1-205ENST00000457029 602 ntTSL 510.67□□□□□ -0.79e-9■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 TGFBR3-208ENST00000529608 785 ntTSL 510.44□□□□□ -0.748e-7■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 ST6GAL1-203ENST00000417392 707 ntTSL 210.1□□□□□ -0.798e-7■□□□□ 8.4
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G3BP1Q13283 PIPOX-202ENST00000419875 518 ntTSL 39.74□□□□□ -0.858e-7■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 SMG1-202ENST00000446231 16115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.928e-7■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 PDXDC1-215ENST00000567306 980 ntTSL 59.21□□□□□ -0.942e-11■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 PDXDC1-201ENST00000325823 1113 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.962e-11■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 CDK6-203ENST00000467166 779 ntTSL 29.03□□□□□ -0.969e-9■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 ATP1A1-205ENST00000440951 579 ntTSL 58.61□□□□□ -1.038e-7■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 BUB3-205ENST00000481952 790 ntTSL 27.62□□□□□ -1.198e-7■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 RAB3GAP1-204ENST00000487003 3506 ntTSL 56.66□□□□□ -1.348e-7■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.358e-7■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 RAB7A-207ENST00000491681 552 ntTSL 26.26□□□□□ -1.418e-7■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 SMG1-211ENST00000565324 12465 ntTSL 1 (best)6.03□□□□□ -1.448e-7■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 MSMO1-204ENST00000505270 482 ntTSL 35.83□□□□□ -1.488e-7■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 GMDS-207ENST00000530459 520 ntTSL 35.66□□□□□ -1.58e-7■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 ST6GAL1-202ENST00000416235 577 ntTSL 25.44□□□□□ -1.548e-7■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.628e-7■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 ST6GAL1-208ENST00000440338 568 ntTSL 44.72□□□□□ -1.658e-7■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 ATP5C1-208ENST00000473809 530 ntTSL 23.92□□□□□ -1.788e-7■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 ATP5C1-209ENST00000480528 460 ntTSL 23.92□□□□□ -1.788e-7■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 LASP1-206ENST00000579123 1874 ntTSL 220.79■□□□□ 0.926e-9■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.566e-9■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 CKAP4-202ENST00000552828 831 ntTSL 314.57□□□□□ -0.086e-9■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 CKAP4-203ENST00000553039 573 ntTSL 46.2□□□□□ -1.426e-9■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC1.2□□□□□ -2.226e-9■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 MORF4L1-222ENST00000560710 908 ntTSL 29.79□□□□□ -0.844e-8■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 MORF4L1-211ENST00000558923 625 ntTSL 37□□□□□ -1.294e-8■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 AC135050.2-202ENST00000532364 499 ntTSL 426.55■■□□□ 1.843e-10■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.473e-10■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.373e-10■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.193e-10■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 VKORC1-207ENST00000472468 461 ntTSL 221.67■■□□□ 1.063e-10■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.053e-10■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.963e-10■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 AC135050.2-201ENST00000533518 2362 ntTSL 1 (best)18.77■□□□□ 0.63e-10■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 VKORC1-206ENST00000420057 746 ntTSL 217.73■□□□□ 0.433e-10■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 VKORC1-203ENST00000354895 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.033e-10■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 EEF1G-204ENST00000532986 578 ntTSL 413.98□□□□□ -0.173e-10■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 VKORC1-208ENST00000498155 870 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.653e-10■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 UQCRC2-203ENST00000561798 699 ntTSL 28.64□□□□□ -1.033e-10■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 DCAF11-227ENST00000560046 686 ntTSL 312.96□□□□□ -0.334e-7■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.998e-9■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 PTMA-211ENST00000468027 621 ntTSL 1 (best)16.08■□□□□ 0.163e-7■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 ECH1-215ENST00000601333 710 ntTSL 218.29■□□□□ 0.522e-6■□□□□ 8.4
G3BP1Q13283 SEPT2-227ENST00000462147 576 ntTSL 430.54■■■□□ 2.482e-7■□□□□ 8.3
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