RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583215.5

PIPOX-210, Transcript of pipecolic acid and sarcosine oxidase, humanhuman

TSL 5

Gene PIPOX, Length 1,829 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPOX-210ENST00000583215 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.63■■■■■ 4.26
PIPOX-210ENST00000583215 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.23■■■■□ 3.39
PIPOX-210ENST00000583215 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.01■■■■□ 3.2
PIPOX-210ENST00000583215 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.45■■■■□ 3.11
PIPOX-210ENST00000583215 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.23■■■■□ 3.07
PIPOX-210ENST00000583215 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.04■■■■□ 3.04
PIPOX-210ENST00000583215 ABCC9O60706 1549 aa34.03■■■■□ 3.04
PIPOX-210ENST00000583215 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.97■■■■□ 3.03
PIPOX-210ENST00000583215 NACADO15069 1562 aa33.68■■■□□ 2.98
PIPOX-210ENST00000583215 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.33■■■□□ 2.93
PIPOX-210ENST00000583215 SCRIBQ14160 1630 aa33.31■■■□□ 2.92
PIPOX-210ENST00000583215 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.84■■■□□ 2.85
PIPOX-210ENST00000583215 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.73■■■□□ 2.83
PIPOX-210ENST00000583215 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.38■■■□□ 2.77
PIPOX-210ENST00000583215 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.37■■■□□ 2.77
PIPOX-210ENST00000583215 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.33■■■□□ 2.77
PIPOX-210ENST00000583215 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.17■■■□□ 2.74
PIPOX-210ENST00000583215 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.13■■■□□ 2.73
PIPOX-210ENST00000583215 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.12■■■□□ 2.73
PIPOX-210ENST00000583215 SMARCA4P51532 1647 aa31.97■■■□□ 2.71
PIPOX-210ENST00000583215 WIZO95785 1651 aa31.92■■■□□ 2.7
PIPOX-210ENST00000583215 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.6■■■□□ 2.65
PIPOX-210ENST00000583215 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.59■■■□□ 2.65
PIPOX-210ENST00000583215 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.59■■■□□ 2.65
PIPOX-210ENST00000583215 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.38■■■□□ 2.61
PIPOX-210ENST00000583215 SMARCA2P51531 1590 aa31.38■■■□□ 2.61
PIPOX-210ENST00000583215 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.34■■■□□ 2.61
PIPOX-210ENST00000583215 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.28■■■□□ 2.6
PIPOX-210ENST00000583215 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.2■■■□□ 2.58
PIPOX-210ENST00000583215 NCAPD3P42695 1498 aa31.09■■■□□ 2.57
PIPOX-210ENST00000583215 HMGXB3Q12766 1538 aa31.06■■■□□ 2.56
PIPOX-210ENST00000583215 TRIM41Q8WV44 630 aa30.87■■■□□ 2.53
PIPOX-210ENST00000583215 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.83■■■□□ 2.53
PIPOX-210ENST00000583215 ABCC8Q09428 1581 aa30.66■■■□□ 2.5
PIPOX-210ENST00000583215 CFTRP13569 1480 aa30.45■■■□□ 2.47
PIPOX-210ENST00000583215 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.44■■■□□ 2.46
PIPOX-210ENST00000583215 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.38■■■□□ 2.45
PIPOX-210ENST00000583215 PRDM2Q13029 1718 aa30.35■■■□□ 2.45
PIPOX-210ENST00000583215 SYNJ1O43426 1573 aa30.33■■■□□ 2.45
PIPOX-210ENST00000583215 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
PIPOX-210ENST00000583215 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.29■■■□□ 2.44
PIPOX-210ENST00000583215 TOP2BQ02880 1626 aa30.2■■■□□ 2.43
PIPOX-210ENST00000583215 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.18■■■□□ 2.42
PIPOX-210ENST00000583215 SOGA1O94964 1423 aa30.13■■■□□ 2.41
PIPOX-210ENST00000583215 EEA1Q15075 1411 aa30.13■■■□□ 2.41
PIPOX-210ENST00000583215 CUX1P39880 1505 aa30.08■■■□□ 2.41
PIPOX-210ENST00000583215 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.02■■■□□ 2.4
PIPOX-210ENST00000583215 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.99■■■□□ 2.39
PIPOX-210ENST00000583215 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.99■■■□□ 2.39
PIPOX-210ENST00000583215 NESP48681 1621 aa29.96■■■□□ 2.39
PIPOX-210ENST00000583215 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.95■■■□□ 2.39
PIPOX-210ENST00000583215 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.93■■■□□ 2.38
PIPOX-210ENST00000583215 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.83■■■□□ 2.37
PIPOX-210ENST00000583215 KIF21BO75037 1637 aa29.74■■■□□ 2.35
PIPOX-210ENST00000583215 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.74■■■□□ 2.35
PIPOX-210ENST00000583215 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.74■■■□□ 2.35
PIPOX-210ENST00000583215 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.74■■■□□ 2.35
PIPOX-210ENST00000583215 GOLGA3Q08378 1498 aa29.71■■■□□ 2.35
PIPOX-210ENST00000583215 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.69■■■□□ 2.34
PIPOX-210ENST00000583215 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.67■■■□□ 2.34
PIPOX-210ENST00000583215 TOPBP1Q92547 1522 aa29.67■■■□□ 2.34
PIPOX-210ENST00000583215 KIF27Q86VH2 1401 aa29.66■■■□□ 2.34
PIPOX-210ENST00000583215 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.62■■■□□ 2.33
PIPOX-210ENST00000583215 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
PIPOX-210ENST00000583215 CUX2O14529 1486 aa29.54■■■□□ 2.32
PIPOX-210ENST00000583215 PRXQ9BXM0 1461 aa29.54■■■□□ 2.32
PIPOX-210ENST00000583215 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
PIPOX-210ENST00000583215 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
PIPOX-210ENST00000583215 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.52■■■□□ 2.32
PIPOX-210ENST00000583215 CEP162Q5TB80 1403 aa29.5■■■□□ 2.31
PIPOX-210ENST00000583215 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.5■■■□□ 2.31
PIPOX-210ENST00000583215 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.46■■■□□ 2.31
PIPOX-210ENST00000583215 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.43■■■□□ 2.3
PIPOX-210ENST00000583215 IGF1RP08069 1367 aa29.39■■■□□ 2.3
PIPOX-210ENST00000583215 WDR97A6NE52 1622 aa29.36■■■□□ 2.29
PIPOX-210ENST00000583215 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.36■■■□□ 2.29
PIPOX-210ENST00000583215 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.24■■■□□ 2.27
PIPOX-210ENST00000583215 CLIP1P30622 1438 aa29.24■■■□□ 2.27
PIPOX-210ENST00000583215 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
PIPOX-210ENST00000583215 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.21■■■□□ 2.27
PIPOX-210ENST00000583215 WDR62O43379 1518 aa29.21■■■□□ 2.27
PIPOX-210ENST00000583215 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.16■■■□□ 2.26
PIPOX-210ENST00000583215 CUL7Q14999 1698 aa29.16■■■□□ 2.26
PIPOX-210ENST00000583215 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
PIPOX-210ENST00000583215 ERCC6Q03468 1493 aa29.14■■■□□ 2.26
PIPOX-210ENST00000583215 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.11■■■□□ 2.25
PIPOX-210ENST00000583215 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
PIPOX-210ENST00000583215 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
PIPOX-210ENST00000583215 IFT140Q96RY7 1462 aa29.03■■■□□ 2.24
PIPOX-210ENST00000583215 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.01■■■□□ 2.23
PIPOX-210ENST00000583215 PBRM1Q86U86 1689 aa28.96■■■□□ 2.23
PIPOX-210ENST00000583215 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.23
PIPOX-210ENST00000583215 ARAP1Q96P48 1450 aa28.95■■■□□ 2.23
PIPOX-210ENST00000583215 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.91■■■□□ 2.221e-7■■■■■ 34.3
PIPOX-210ENST00000583215 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.9■■■□□ 2.22
PIPOX-210ENST00000583215 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
PIPOX-210ENST00000583215 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.87■■■□□ 2.21
PIPOX-210ENST00000583215 GRIN2BQ13224 1484 aa28.86■■■□□ 2.21
PIPOX-210ENST00000583215 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
PIPOX-210ENST00000583215 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.81■■■□□ 2.2
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