RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469082.1

PIPOX-204, Transcript of pipecolic acid and sarcosine oxidase, humanhuman

TSL 5

Gene PIPOX, Length 760 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPOX-204ENST00000469082 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.71■■■□□ 2.35
PIPOX-204ENST00000469082 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.45■■□□□ 1.82
PIPOX-204ENST00000469082 ABCC9O60706 1549 aa25.84■■□□□ 1.73
PIPOX-204ENST00000469082 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.88■■□□□ 1.57
PIPOX-204ENST00000469082 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.87■■□□□ 1.57
PIPOX-204ENST00000469082 NACADO15069 1562 aa24.83■■□□□ 1.57
PIPOX-204ENST00000469082 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
PIPOX-204ENST00000469082 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.64■■□□□ 1.53
PIPOX-204ENST00000469082 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.56■■□□□ 1.52
PIPOX-204ENST00000469082 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.32■■□□□ 1.48
PIPOX-204ENST00000469082 SCRIBQ14160 1630 aa24.17■■□□□ 1.46
PIPOX-204ENST00000469082 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.13■■□□□ 1.45
PIPOX-204ENST00000469082 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.08■■□□□ 1.44
PIPOX-204ENST00000469082 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.83■■□□□ 1.41
PIPOX-204ENST00000469082 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.6■■□□□ 1.37
PIPOX-204ENST00000469082 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
PIPOX-204ENST00000469082 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.37■■□□□ 1.33
PIPOX-204ENST00000469082 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.21■■□□□ 1.31
PIPOX-204ENST00000469082 SMARCA4P51532 1647 aa23.08■■□□□ 1.29
PIPOX-204ENST00000469082 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
PIPOX-204ENST00000469082 SMARCA2P51531 1590 aa22.92■■□□□ 1.26
PIPOX-204ENST00000469082 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.91■■□□□ 1.26
PIPOX-204ENST00000469082 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.9■■□□□ 1.26
PIPOX-204ENST00000469082 NCAPD3P42695 1498 aa22.87■■□□□ 1.25
PIPOX-204ENST00000469082 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.82■■□□□ 1.24
PIPOX-204ENST00000469082 HMGXB3Q12766 1538 aa22.81■■□□□ 1.24
PIPOX-204ENST00000469082 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
PIPOX-204ENST00000469082 WIZO95785 1651 aa22.7■■□□□ 1.22
PIPOX-204ENST00000469082 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
PIPOX-204ENST00000469082 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
PIPOX-204ENST00000469082 NESP48681 1621 aa22.35■■□□□ 1.17
PIPOX-204ENST00000469082 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.32■■□□□ 1.16
PIPOX-204ENST00000469082 ERCC6Q03468 1493 aa22.31■■□□□ 1.16
PIPOX-204ENST00000469082 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.22■■□□□ 1.15
PIPOX-204ENST00000469082 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.16■■□□□ 1.14
PIPOX-204ENST00000469082 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PIPOX-204ENST00000469082 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.15■■□□□ 1.14
PIPOX-204ENST00000469082 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.14■■□□□ 1.14
PIPOX-204ENST00000469082 CFTRP13569 1480 aa22.1■■□□□ 1.13
PIPOX-204ENST00000469082 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PIPOX-204ENST00000469082 PRDM2Q13029 1718 aa22.02■■□□□ 1.12
PIPOX-204ENST00000469082 CUX2O14529 1486 aa22■■□□□ 1.11
PIPOX-204ENST00000469082 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22■■□□□ 1.11
PIPOX-204ENST00000469082 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.99■■□□□ 1.11
PIPOX-204ENST00000469082 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.94■■□□□ 1.1
PIPOX-204ENST00000469082 WDR62O43379 1518 aa21.86■■□□□ 1.09
PIPOX-204ENST00000469082 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
PIPOX-204ENST00000469082 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.65■■□□□ 1.06
PIPOX-204ENST00000469082 TOPBP1Q92547 1522 aa21.65■■□□□ 1.06
PIPOX-204ENST00000469082 ABCC8Q09428 1581 aa21.64■■□□□ 1.05
PIPOX-204ENST00000469082 IFT140Q96RY7 1462 aa21.51■■□□□ 1.03
PIPOX-204ENST00000469082 CUX1P39880 1505 aa21.49■■□□□ 1.03
PIPOX-204ENST00000469082 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PIPOX-204ENST00000469082 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.44■■□□□ 1.02
PIPOX-204ENST00000469082 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
PIPOX-204ENST00000469082 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
PIPOX-204ENST00000469082 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.38■■□□□ 1.01
PIPOX-204ENST00000469082 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.38■■□□□ 1.01
PIPOX-204ENST00000469082 SOGA1O94964 1423 aa21.38■■□□□ 1.01
PIPOX-204ENST00000469082 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
PIPOX-204ENST00000469082 SYNJ1O43426 1573 aa21.34■■□□□ 1.01
PIPOX-204ENST00000469082 TOP2BQ02880 1626 aa21.33■■□□□ 1.01
PIPOX-204ENST00000469082 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.33■■□□□ 1.01
PIPOX-204ENST00000469082 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.29■■□□□ 11e-7■■■■■ 34.3
PIPOX-204ENST00000469082 WDR97A6NE52 1622 aa21.26■□□□□ 0.99
PIPOX-204ENST00000469082 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
PIPOX-204ENST00000469082 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.24■□□□□ 0.99
PIPOX-204ENST00000469082 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.2■□□□□ 0.98
PIPOX-204ENST00000469082 PBRM1Q86U86 1689 aa21.15■□□□□ 0.98
PIPOX-204ENST00000469082 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.15■□□□□ 0.98
PIPOX-204ENST00000469082 GRIN2BQ13224 1484 aa21.13■□□□□ 0.97
PIPOX-204ENST00000469082 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.13■□□□□ 0.97
PIPOX-204ENST00000469082 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.11■□□□□ 0.97
PIPOX-204ENST00000469082 CHD1O14646 1710 aa21.09■□□□□ 0.97
PIPOX-204ENST00000469082 OSCARQ8IYS5 282 aa21.08■□□□□ 0.97
PIPOX-204ENST00000469082 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
PIPOX-204ENST00000469082 FBLN2P98095 1184 aa21.07■□□□□ 0.96
PIPOX-204ENST00000469082 SYNJ2O15056 1496 aa21■□□□□ 0.95
PIPOX-204ENST00000469082 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
PIPOX-204ENST00000469082 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.96■□□□□ 0.95
PIPOX-204ENST00000469082 ADAMTS12P58397 1594 aa20.95■□□□□ 0.94
PIPOX-204ENST00000469082 KIF27Q86VH2 1401 aa20.94■□□□□ 0.94
PIPOX-204ENST00000469082 TRIM41Q8WV44 630 aa20.92■□□□□ 0.94
PIPOX-204ENST00000469082 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.88■□□□□ 0.93
PIPOX-204ENST00000469082 GRIN2AQ12879 1464 aa20.87■□□□□ 0.93
PIPOX-204ENST00000469082 CUL7Q14999 1698 aa20.82■□□□□ 0.92
PIPOX-204ENST00000469082 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.82■□□□□ 0.92
PIPOX-204ENST00000469082 IGF1RP08069 1367 aa20.79■□□□□ 0.92
PIPOX-204ENST00000469082 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.78■□□□□ 0.92
PIPOX-204ENST00000469082 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.78■□□□□ 0.92
PIPOX-204ENST00000469082 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.78■□□□□ 0.92
PIPOX-204ENST00000469082 ARHGEF11O15085 1522 aa20.78■□□□□ 0.92
PIPOX-204ENST00000469082 CEP170Q5SW79 1584 aa20.77■□□□□ 0.92
PIPOX-204ENST00000469082 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.73■□□□□ 0.91
PIPOX-204ENST00000469082 NUP160Q12769 1436 aa20.73■□□□□ 0.91
PIPOX-204ENST00000469082 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.7■□□□□ 0.9
PIPOX-204ENST00000469082 CHIC1Q5VXU3 224 aa20.63■□□□□ 0.89
PIPOX-204ENST00000469082 SHROOM2Q13796 1616 aa20.6■□□□□ 0.89
PIPOX-204ENST00000469082 ARAP1Q96P48 1450 aa20.6■□□□□ 0.89
PIPOX-204ENST00000469082 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms