RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580241.5

PIPOX-208, Transcript of pipecolic acid and sarcosine oxidase, humanhuman

TSL 5

Gene PIPOX, Length 1,772 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPOX-208ENST00000580241 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.95■■■■■ 5.11
PIPOX-208ENST00000580241 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.38■■■■■ 4.21
PIPOX-208ENST00000580241 ABCC9O60706 1549 aa39.82■■■■□ 3.97
PIPOX-208ENST00000580241 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.3■■■■□ 3.88
PIPOX-208ENST00000580241 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39■■■■□ 3.83
PIPOX-208ENST00000580241 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.78■■■■□ 3.8
PIPOX-208ENST00000580241 NACADO15069 1562 aa38.66■■■■□ 3.78
PIPOX-208ENST00000580241 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.62■■■■□ 3.77
PIPOX-208ENST00000580241 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.56■■■■□ 3.76
PIPOX-208ENST00000580241 SCRIBQ14160 1630 aa37.96■■■■□ 3.67
PIPOX-208ENST00000580241 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.85■■■■□ 3.65
PIPOX-208ENST00000580241 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.76■■■■□ 3.64
PIPOX-208ENST00000580241 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.41■■■■□ 3.58
PIPOX-208ENST00000580241 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.34■■■■□ 3.57
PIPOX-208ENST00000580241 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.55■■■■□ 3.44
PIPOX-208ENST00000580241 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.37■■■■□ 3.41
PIPOX-208ENST00000580241 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.33■■■■□ 3.41
PIPOX-208ENST00000580241 SMARCA4P51532 1647 aa36.31■■■■□ 3.4
PIPOX-208ENST00000580241 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.26■■■■□ 3.4
PIPOX-208ENST00000580241 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.09■■■■□ 3.37
PIPOX-208ENST00000580241 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.04■■■■□ 3.36
PIPOX-208ENST00000580241 WIZO95785 1651 aa35.96■■■■□ 3.35
PIPOX-208ENST00000580241 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.88■■■■□ 3.33
PIPOX-208ENST00000580241 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.86■■■■□ 3.33
PIPOX-208ENST00000580241 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.85■■■■□ 3.33
PIPOX-208ENST00000580241 SMARCA2P51531 1590 aa35.83■■■■□ 3.33
PIPOX-208ENST00000580241 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.78■■■■□ 3.32
PIPOX-208ENST00000580241 NCAPD3P42695 1498 aa35.65■■■■□ 3.3
PIPOX-208ENST00000580241 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
PIPOX-208ENST00000580241 HMGXB3Q12766 1538 aa35.6■■■■□ 3.29
PIPOX-208ENST00000580241 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.53■■■■□ 3.28
PIPOX-208ENST00000580241 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.12■■■■□ 3.21
PIPOX-208ENST00000580241 NESP48681 1621 aa34.72■■■■□ 3.15
PIPOX-208ENST00000580241 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.68■■■■□ 3.14
PIPOX-208ENST00000580241 CFTRP13569 1480 aa34.66■■■■□ 3.14
PIPOX-208ENST00000580241 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.64■■■■□ 3.14
PIPOX-208ENST00000580241 PRDM2Q13029 1718 aa34.57■■■■□ 3.12
PIPOX-208ENST00000580241 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.36■■■■□ 3.09
PIPOX-208ENST00000580241 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.34■■■■□ 3.09
PIPOX-208ENST00000580241 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.34■■■■□ 3.09
PIPOX-208ENST00000580241 ERCC6Q03468 1493 aa34.23■■■■□ 3.07
PIPOX-208ENST00000580241 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.23■■■■□ 3.07
PIPOX-208ENST00000580241 ABCC8Q09428 1581 aa34.2■■■■□ 3.07
PIPOX-208ENST00000580241 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.01■■■■□ 3.04
PIPOX-208ENST00000580241 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.99■■■■□ 3.03
PIPOX-208ENST00000580241 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.98■■■■□ 3.03
PIPOX-208ENST00000580241 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.97■■■■□ 3.03
PIPOX-208ENST00000580241 SYNJ1O43426 1573 aa33.96■■■■□ 3.03
PIPOX-208ENST00000580241 CUX1P39880 1505 aa33.96■■■■□ 3.03
PIPOX-208ENST00000580241 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.91■■■■□ 3.02
PIPOX-208ENST00000580241 TOPBP1Q92547 1522 aa33.89■■■■□ 3.02
PIPOX-208ENST00000580241 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.88■■■■□ 3.01
PIPOX-208ENST00000580241 TOP2BQ02880 1626 aa33.87■■■■□ 3.01
PIPOX-208ENST00000580241 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.86■■■■□ 3.01
PIPOX-208ENST00000580241 WDR62O43379 1518 aa33.86■■■■□ 3.01
PIPOX-208ENST00000580241 TRIM41Q8WV44 630 aa33.77■■■■□ 3
PIPOX-208ENST00000580241 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.72■■■□□ 2.99
PIPOX-208ENST00000580241 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.67■■■□□ 2.98
PIPOX-208ENST00000580241 CUX2O14529 1486 aa33.55■■■□□ 2.96
PIPOX-208ENST00000580241 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.55■■■□□ 2.96
PIPOX-208ENST00000580241 SOGA1O94964 1423 aa33.5■■■□□ 2.95
PIPOX-208ENST00000580241 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.47■■■□□ 2.95
PIPOX-208ENST00000580241 WDR97A6NE52 1622 aa33.43■■■□□ 2.94
PIPOX-208ENST00000580241 IFT140Q96RY7 1462 aa33.42■■■□□ 2.94
PIPOX-208ENST00000580241 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.37■■■□□ 2.93
PIPOX-208ENST00000580241 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.31■■■□□ 2.92
PIPOX-208ENST00000580241 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.27■■■□□ 2.92
PIPOX-208ENST00000580241 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.26■■■□□ 2.92
PIPOX-208ENST00000580241 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.24■■■□□ 2.91
PIPOX-208ENST00000580241 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.23■■■□□ 2.91
PIPOX-208ENST00000580241 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.21■■■□□ 2.911e-7■■■■■ 34.3
PIPOX-208ENST00000580241 KIF27Q86VH2 1401 aa33.2■■■□□ 2.91
PIPOX-208ENST00000580241 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP33.17■■■□□ 2.9
PIPOX-208ENST00000580241 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.14■■■□□ 2.9
PIPOX-208ENST00000580241 PBRM1Q86U86 1689 aa33.12■■■□□ 2.89
PIPOX-208ENST00000580241 EEA1Q15075 1411 aa33.04■■■□□ 2.88
PIPOX-208ENST00000580241 GRIN2BQ13224 1484 aa33■■■□□ 2.87
PIPOX-208ENST00000580241 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.98■■■□□ 2.87
PIPOX-208ENST00000580241 IGF1RP08069 1367 aa32.96■■■□□ 2.87
PIPOX-208ENST00000580241 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.93■■■□□ 2.86
PIPOX-208ENST00000580241 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.92■■■□□ 2.86
PIPOX-208ENST00000580241 CUL7Q14999 1698 aa32.88■■■□□ 2.85
PIPOX-208ENST00000580241 ADAMTS12P58397 1594 aa32.86■■■□□ 2.85
PIPOX-208ENST00000580241 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.83■■■□□ 2.85
PIPOX-208ENST00000580241 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.79■■■□□ 2.84
PIPOX-208ENST00000580241 EHMT2Q96KQ7 1210 aa32.78■■■□□ 2.84
PIPOX-208ENST00000580241 PRXQ9BXM0 1461 aa32.77■■■□□ 2.84
PIPOX-208ENST00000580241 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.75■■■□□ 2.83
PIPOX-208ENST00000580241 KIF21BO75037 1637 aa32.75■■■□□ 2.83
PIPOX-208ENST00000580241 SYNJ2O15056 1496 aa32.72■■■□□ 2.83
PIPOX-208ENST00000580241 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa32.7■■■□□ 2.83
PIPOX-208ENST00000580241 CHD1O14646 1710 aa32.69■■■□□ 2.82
PIPOX-208ENST00000580241 FBLN2P98095 1184 aa32.68■■■□□ 2.82
PIPOX-208ENST00000580241 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.63■■■□□ 2.81
PIPOX-208ENST00000580241 GRIN2AQ12879 1464 aa32.62■■■□□ 2.81
PIPOX-208ENST00000580241 GOLGA3Q08378 1498 aa32.61■■■□□ 2.81
PIPOX-208ENST00000580241 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa32.57■■■□□ 2.8
PIPOX-208ENST00000580241 CEP170Q5SW79 1584 aa32.48■■■□□ 2.79
PIPOX-208ENST00000580241 UBTFP17480 764 aaKnown RBP32.47■■■□□ 2.79
PIPOX-208ENST00000580241 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa32.45■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms