Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y8

SEC23IP, SEC23-interacting protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,000 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23IPQ9Y6Y8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC23IPQ9Y6Y8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC23IPQ9Y6Y8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC23IPQ9Y6Y8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC23IPQ9Y6Y8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC23IPQ9Y6Y8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC23IPQ9Y6Y8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEC23IPQ9Y6Y8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEC23IPQ9Y6Y8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEC23IPQ9Y6Y8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEC23IPQ9Y6Y8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEC23IPQ9Y6Y8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEC23IPQ9Y6Y8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEC23IPQ9Y6Y8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC23IPQ9Y6Y8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC23IPQ9Y6Y8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC23IPQ9Y6Y8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC23IPQ9Y6Y8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC23IPQ9Y6Y8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC23IPQ9Y6Y8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC23IPQ9Y6Y8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC23IPQ9Y6Y8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC23IPQ9Y6Y8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC23IPQ9Y6Y8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC23IPQ9Y6Y8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC23IPQ9Y6Y8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC23IPQ9Y6Y8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC23IPQ9Y6Y8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC23IPQ9Y6Y8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC23IPQ9Y6Y8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC23IPQ9Y6Y8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC23IPQ9Y6Y8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC23IPQ9Y6Y8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC23IPQ9Y6Y8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC23IPQ9Y6Y8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEC23IPQ9Y6Y8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEC23IPQ9Y6Y8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEC23IPQ9Y6Y8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEC23IPQ9Y6Y8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEC23IPQ9Y6Y8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC23IPQ9Y6Y8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC23IPQ9Y6Y8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC23IPQ9Y6Y8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC23IPQ9Y6Y8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC23IPQ9Y6Y8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC23IPQ9Y6Y8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEC23IPQ9Y6Y8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEC23IPQ9Y6Y8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEC23IPQ9Y6Y8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEC23IPQ9Y6Y8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEC23IPQ9Y6Y8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEC23IPQ9Y6Y8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC23IPQ9Y6Y8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC23IPQ9Y6Y8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC23IPQ9Y6Y8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC23IPQ9Y6Y8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC23IPQ9Y6Y8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC23IPQ9Y6Y8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC23IPQ9Y6Y8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SEC23IPQ9Y6Y8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC23IPQ9Y6Y8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC23IPQ9Y6Y8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC23IPQ9Y6Y8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC23IPQ9Y6Y8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC23IPQ9Y6Y8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC23IPQ9Y6Y8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC23IPQ9Y6Y8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC23IPQ9Y6Y8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC23IPQ9Y6Y8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC23IPQ9Y6Y8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC23IPQ9Y6Y8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC23IPQ9Y6Y8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC23IPQ9Y6Y8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC23IPQ9Y6Y8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC23IPQ9Y6Y8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC23IPQ9Y6Y8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC23IPQ9Y6Y8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC23IPQ9Y6Y8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC23IPQ9Y6Y8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC23IPQ9Y6Y8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEC23IPQ9Y6Y8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SEC23IPQ9Y6Y8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEC23IPQ9Y6Y8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEC23IPQ9Y6Y8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEC23IPQ9Y6Y8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEC23IPQ9Y6Y8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEC23IPQ9Y6Y8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEC23IPQ9Y6Y8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC23IPQ9Y6Y8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC23IPQ9Y6Y8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC23IPQ9Y6Y8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC23IPQ9Y6Y8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC23IPQ9Y6Y8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC23IPQ9Y6Y8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC23IPQ9Y6Y8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC23IPQ9Y6Y8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC23IPQ9Y6Y8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC23IPQ9Y6Y8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC23IPQ9Y6Y8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC23IPQ9Y6Y8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 232.1 ms