Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COL4A3BPQ9Y5P4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
COL4A3BPQ9Y5P4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
COL4A3BPQ9Y5P4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
COL4A3BPQ9Y5P4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
COL4A3BPQ9Y5P4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
COL4A3BPQ9Y5P4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
COL4A3BPQ9Y5P4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
COL4A3BPQ9Y5P4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COL4A3BPQ9Y5P4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COL4A3BPQ9Y5P4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COL4A3BPQ9Y5P4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COL4A3BPQ9Y5P4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COL4A3BPQ9Y5P4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COL4A3BPQ9Y5P4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COL4A3BPQ9Y5P4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COL4A3BPQ9Y5P4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COL4A3BPQ9Y5P4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COL4A3BPQ9Y5P4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COL4A3BPQ9Y5P4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
COL4A3BPQ9Y5P4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
COL4A3BPQ9Y5P4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
COL4A3BPQ9Y5P4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
COL4A3BPQ9Y5P4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
COL4A3BPQ9Y5P4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
COL4A3BPQ9Y5P4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
COL4A3BPQ9Y5P4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
COL4A3BPQ9Y5P4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
COL4A3BPQ9Y5P4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
COL4A3BPQ9Y5P4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
COL4A3BPQ9Y5P4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
COL4A3BPQ9Y5P4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COL4A3BPQ9Y5P4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COL4A3BPQ9Y5P4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
COL4A3BPQ9Y5P4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COL4A3BPQ9Y5P4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL4A3BPQ9Y5P4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL4A3BPQ9Y5P4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL4A3BPQ9Y5P4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL4A3BPQ9Y5P4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL4A3BPQ9Y5P4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COL4A3BPQ9Y5P4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COL4A3BPQ9Y5P4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
COL4A3BPQ9Y5P4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
COL4A3BPQ9Y5P4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL4A3BPQ9Y5P4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL4A3BPQ9Y5P4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
COL4A3BPQ9Y5P4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL4A3BPQ9Y5P4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL4A3BPQ9Y5P4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
COL4A3BPQ9Y5P4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
COL4A3BPQ9Y5P4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
COL4A3BPQ9Y5P4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL4A3BPQ9Y5P4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL4A3BPQ9Y5P4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL4A3BPQ9Y5P4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
COL4A3BPQ9Y5P4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
COL4A3BPQ9Y5P4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
COL4A3BPQ9Y5P4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
COL4A3BPQ9Y5P4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
COL4A3BPQ9Y5P4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
COL4A3BPQ9Y5P4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
COL4A3BPQ9Y5P4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
COL4A3BPQ9Y5P4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
COL4A3BPQ9Y5P4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
COL4A3BPQ9Y5P4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COL4A3BPQ9Y5P4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COL4A3BPQ9Y5P4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
COL4A3BPQ9Y5P4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COL4A3BPQ9Y5P4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
COL4A3BPQ9Y5P4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
COL4A3BPQ9Y5P4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL4A3BPQ9Y5P4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL4A3BPQ9Y5P4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL4A3BPQ9Y5P4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL4A3BPQ9Y5P4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL4A3BPQ9Y5P4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
COL4A3BPQ9Y5P4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL4A3BPQ9Y5P4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
COL4A3BPQ9Y5P4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
COL4A3BPQ9Y5P4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
COL4A3BPQ9Y5P4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
COL4A3BPQ9Y5P4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
COL4A3BPQ9Y5P4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
COL4A3BPQ9Y5P4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
COL4A3BPQ9Y5P4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COL4A3BPQ9Y5P4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COL4A3BPQ9Y5P4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COL4A3BPQ9Y5P4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL4A3BPQ9Y5P4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL4A3BPQ9Y5P4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL4A3BPQ9Y5P4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL4A3BPQ9Y5P4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms