Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y466

NR2E1, Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2E1Q9Y466 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
NR2E1Q9Y466 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NR2E1Q9Y466 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NR2E1Q9Y466 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NR2E1Q9Y466 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NR2E1Q9Y466 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NR2E1Q9Y466 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NR2E1Q9Y466 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NR2E1Q9Y466 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NR2E1Q9Y466 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NR2E1Q9Y466 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NR2E1Q9Y466 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NR2E1Q9Y466 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NR2E1Q9Y466 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NR2E1Q9Y466 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NR2E1Q9Y466 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NR2E1Q9Y466 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NR2E1Q9Y466 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NR2E1Q9Y466 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NR2E1Q9Y466 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NR2E1Q9Y466 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NR2E1Q9Y466 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NR2E1Q9Y466 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NR2E1Q9Y466 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NR2E1Q9Y466 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NR2E1Q9Y466 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NR2E1Q9Y466 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NR2E1Q9Y466 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NR2E1Q9Y466 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NR2E1Q9Y466 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NR2E1Q9Y466 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NR2E1Q9Y466 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NR2E1Q9Y466 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NR2E1Q9Y466 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NR2E1Q9Y466 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NR2E1Q9Y466 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NR2E1Q9Y466 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NR2E1Q9Y466 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NR2E1Q9Y466 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NR2E1Q9Y466 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NR2E1Q9Y466 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NR2E1Q9Y466 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NR2E1Q9Y466 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NR2E1Q9Y466 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NR2E1Q9Y466 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NR2E1Q9Y466 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NR2E1Q9Y466 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NR2E1Q9Y466 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NR2E1Q9Y466 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NR2E1Q9Y466 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NR2E1Q9Y466 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NR2E1Q9Y466 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NR2E1Q9Y466 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NR2E1Q9Y466 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NR2E1Q9Y466 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NR2E1Q9Y466 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NR2E1Q9Y466 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NR2E1Q9Y466 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NR2E1Q9Y466 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NR2E1Q9Y466 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NR2E1Q9Y466 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NR2E1Q9Y466 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NR2E1Q9Y466 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NR2E1Q9Y466 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NR2E1Q9Y466 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NR2E1Q9Y466 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NR2E1Q9Y466 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NR2E1Q9Y466 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NR2E1Q9Y466 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NR2E1Q9Y466 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NR2E1Q9Y466 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NR2E1Q9Y466 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NR2E1Q9Y466 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NR2E1Q9Y466 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NR2E1Q9Y466 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NR2E1Q9Y466 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NR2E1Q9Y466 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NR2E1Q9Y466 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NR2E1Q9Y466 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NR2E1Q9Y466 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NR2E1Q9Y466 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NR2E1Q9Y466 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NR2E1Q9Y466 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NR2E1Q9Y466 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NR2E1Q9Y466 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NR2E1Q9Y466 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NR2E1Q9Y466 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NR2E1Q9Y466 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NR2E1Q9Y466 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NR2E1Q9Y466 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NR2E1Q9Y466 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NR2E1Q9Y466 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NR2E1Q9Y466 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NR2E1Q9Y466 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NR2E1Q9Y466 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NR2E1Q9Y466 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NR2E1Q9Y466 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NR2E1Q9Y466 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NR2E1Q9Y466 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NR2E1Q9Y466 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms