Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M5

KLHL20, Kelch-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL20Q9Y2M5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL20Q9Y2M5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL20Q9Y2M5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL20Q9Y2M5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL20Q9Y2M5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL20Q9Y2M5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL20Q9Y2M5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL20Q9Y2M5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL20Q9Y2M5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL20Q9Y2M5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL20Q9Y2M5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL20Q9Y2M5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL20Q9Y2M5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL20Q9Y2M5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL20Q9Y2M5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL20Q9Y2M5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL20Q9Y2M5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL20Q9Y2M5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL20Q9Y2M5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL20Q9Y2M5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL20Q9Y2M5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL20Q9Y2M5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KLHL20Q9Y2M5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL20Q9Y2M5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL20Q9Y2M5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL20Q9Y2M5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL20Q9Y2M5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL20Q9Y2M5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL20Q9Y2M5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL20Q9Y2M5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL20Q9Y2M5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL20Q9Y2M5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL20Q9Y2M5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL20Q9Y2M5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL20Q9Y2M5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL20Q9Y2M5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL20Q9Y2M5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL20Q9Y2M5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL20Q9Y2M5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL20Q9Y2M5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL20Q9Y2M5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL20Q9Y2M5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL20Q9Y2M5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL20Q9Y2M5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL20Q9Y2M5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL20Q9Y2M5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL20Q9Y2M5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL20Q9Y2M5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL20Q9Y2M5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL20Q9Y2M5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL20Q9Y2M5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL20Q9Y2M5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL20Q9Y2M5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL20Q9Y2M5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL20Q9Y2M5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL20Q9Y2M5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL20Q9Y2M5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL20Q9Y2M5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL20Q9Y2M5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL20Q9Y2M5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL20Q9Y2M5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL20Q9Y2M5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL20Q9Y2M5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL20Q9Y2M5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL20Q9Y2M5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL20Q9Y2M5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL20Q9Y2M5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL20Q9Y2M5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL20Q9Y2M5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL20Q9Y2M5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL20Q9Y2M5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL20Q9Y2M5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL20Q9Y2M5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL20Q9Y2M5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL20Q9Y2M5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL20Q9Y2M5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL20Q9Y2M5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL20Q9Y2M5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL20Q9Y2M5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL20Q9Y2M5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL20Q9Y2M5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL20Q9Y2M5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL20Q9Y2M5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL20Q9Y2M5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL20Q9Y2M5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL20Q9Y2M5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL20Q9Y2M5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL20Q9Y2M5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL20Q9Y2M5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL20Q9Y2M5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL20Q9Y2M5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL20Q9Y2M5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL20Q9Y2M5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL20Q9Y2M5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL20Q9Y2M5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL20Q9Y2M5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL20Q9Y2M5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL20Q9Y2M5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL20Q9Y2M5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL20Q9Y2M5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms