Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN79

SOX13, Transcription factor SOX-13, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX13Q9UN79 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOX13Q9UN79 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOX13Q9UN79 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOX13Q9UN79 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SOX13Q9UN79 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOX13Q9UN79 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOX13Q9UN79 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOX13Q9UN79 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SOX13Q9UN79 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SOX13Q9UN79 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SOX13Q9UN79 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SOX13Q9UN79 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SOX13Q9UN79 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SOX13Q9UN79 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SOX13Q9UN79 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SOX13Q9UN79 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOX13Q9UN79 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOX13Q9UN79 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOX13Q9UN79 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SOX13Q9UN79 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOX13Q9UN79 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOX13Q9UN79 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOX13Q9UN79 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOX13Q9UN79 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOX13Q9UN79 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOX13Q9UN79 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOX13Q9UN79 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOX13Q9UN79 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOX13Q9UN79 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SOX13Q9UN79 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SOX13Q9UN79 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOX13Q9UN79 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SOX13Q9UN79 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOX13Q9UN79 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOX13Q9UN79 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOX13Q9UN79 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SOX13Q9UN79 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOX13Q9UN79 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOX13Q9UN79 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOX13Q9UN79 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOX13Q9UN79 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOX13Q9UN79 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOX13Q9UN79 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SOX13Q9UN79 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOX13Q9UN79 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOX13Q9UN79 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOX13Q9UN79 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOX13Q9UN79 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOX13Q9UN79 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOX13Q9UN79 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOX13Q9UN79 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOX13Q9UN79 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOX13Q9UN79 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOX13Q9UN79 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOX13Q9UN79 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOX13Q9UN79 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOX13Q9UN79 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOX13Q9UN79 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOX13Q9UN79 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOX13Q9UN79 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOX13Q9UN79 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOX13Q9UN79 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOX13Q9UN79 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOX13Q9UN79 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOX13Q9UN79 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOX13Q9UN79 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOX13Q9UN79 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOX13Q9UN79 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOX13Q9UN79 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOX13Q9UN79 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOX13Q9UN79 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOX13Q9UN79 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOX13Q9UN79 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOX13Q9UN79 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOX13Q9UN79 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOX13Q9UN79 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOX13Q9UN79 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOX13Q9UN79 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOX13Q9UN79 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOX13Q9UN79 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOX13Q9UN79 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOX13Q9UN79 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOX13Q9UN79 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOX13Q9UN79 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOX13Q9UN79 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SOX13Q9UN79 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SOX13Q9UN79 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SOX13Q9UN79 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SOX13Q9UN79 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SOX13Q9UN79 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SOX13Q9UN79 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOX13Q9UN79 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOX13Q9UN79 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOX13Q9UN79 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOX13Q9UN79 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOX13Q9UN79 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOX13Q9UN79 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOX13Q9UN79 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOX13Q9UN79 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOX13Q9UN79 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms