Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD8

KCNH3, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH3Q9ULD8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
KCNH3Q9ULD8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
KCNH3Q9ULD8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KCNH3Q9ULD8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KCNH3Q9ULD8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KCNH3Q9ULD8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KCNH3Q9ULD8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KCNH3Q9ULD8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KCNH3Q9ULD8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KCNH3Q9ULD8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KCNH3Q9ULD8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KCNH3Q9ULD8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KCNH3Q9ULD8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KCNH3Q9ULD8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KCNH3Q9ULD8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KCNH3Q9ULD8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KCNH3Q9ULD8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KCNH3Q9ULD8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNH3Q9ULD8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNH3Q9ULD8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNH3Q9ULD8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KCNH3Q9ULD8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
KCNH3Q9ULD8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KCNH3Q9ULD8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KCNH3Q9ULD8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KCNH3Q9ULD8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KCNH3Q9ULD8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KCNH3Q9ULD8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KCNH3Q9ULD8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KCNH3Q9ULD8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
KCNH3Q9ULD8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KCNH3Q9ULD8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KCNH3Q9ULD8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KCNH3Q9ULD8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KCNH3Q9ULD8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KCNH3Q9ULD8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KCNH3Q9ULD8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KCNH3Q9ULD8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KCNH3Q9ULD8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KCNH3Q9ULD8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KCNH3Q9ULD8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KCNH3Q9ULD8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KCNH3Q9ULD8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
KCNH3Q9ULD8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNH3Q9ULD8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNH3Q9ULD8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNH3Q9ULD8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNH3Q9ULD8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KCNH3Q9ULD8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KCNH3Q9ULD8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KCNH3Q9ULD8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KCNH3Q9ULD8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KCNH3Q9ULD8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KCNH3Q9ULD8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KCNH3Q9ULD8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KCNH3Q9ULD8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KCNH3Q9ULD8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KCNH3Q9ULD8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KCNH3Q9ULD8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KCNH3Q9ULD8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KCNH3Q9ULD8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KCNH3Q9ULD8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNH3Q9ULD8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNH3Q9ULD8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KCNH3Q9ULD8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
KCNH3Q9ULD8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KCNH3Q9ULD8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNH3Q9ULD8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNH3Q9ULD8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNH3Q9ULD8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNH3Q9ULD8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNH3Q9ULD8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNH3Q9ULD8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNH3Q9ULD8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNH3Q9ULD8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNH3Q9ULD8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNH3Q9ULD8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KCNH3Q9ULD8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KCNH3Q9ULD8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KCNH3Q9ULD8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KCNH3Q9ULD8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KCNH3Q9ULD8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNH3Q9ULD8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNH3Q9ULD8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNH3Q9ULD8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNH3Q9ULD8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNH3Q9ULD8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNH3Q9ULD8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNH3Q9ULD8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNH3Q9ULD8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNH3Q9ULD8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNH3Q9ULD8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KCNH3Q9ULD8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KCNH3Q9ULD8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
KCNH3Q9ULD8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KCNH3Q9ULD8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KCNH3Q9ULD8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KCNH3Q9ULD8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KCNH3Q9ULD8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KCNH3Q9ULD8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms