Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV3

MID2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID2Q9UJV3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MID2Q9UJV3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MID2Q9UJV3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MID2Q9UJV3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MID2Q9UJV3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MID2Q9UJV3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MID2Q9UJV3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MID2Q9UJV3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MID2Q9UJV3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MID2Q9UJV3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MID2Q9UJV3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MID2Q9UJV3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MID2Q9UJV3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MID2Q9UJV3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MID2Q9UJV3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MID2Q9UJV3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MID2Q9UJV3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MID2Q9UJV3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MID2Q9UJV3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MID2Q9UJV3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MID2Q9UJV3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MID2Q9UJV3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MID2Q9UJV3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MID2Q9UJV3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MID2Q9UJV3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MID2Q9UJV3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MID2Q9UJV3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MID2Q9UJV3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MID2Q9UJV3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MID2Q9UJV3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MID2Q9UJV3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MID2Q9UJV3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MID2Q9UJV3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MID2Q9UJV3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MID2Q9UJV3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MID2Q9UJV3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MID2Q9UJV3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MID2Q9UJV3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MID2Q9UJV3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MID2Q9UJV3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MID2Q9UJV3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MID2Q9UJV3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MID2Q9UJV3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MID2Q9UJV3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MID2Q9UJV3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MID2Q9UJV3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MID2Q9UJV3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MID2Q9UJV3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MID2Q9UJV3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MID2Q9UJV3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MID2Q9UJV3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MID2Q9UJV3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MID2Q9UJV3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MID2Q9UJV3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MID2Q9UJV3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MID2Q9UJV3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MID2Q9UJV3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MID2Q9UJV3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MID2Q9UJV3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MID2Q9UJV3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MID2Q9UJV3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MID2Q9UJV3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MID2Q9UJV3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MID2Q9UJV3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MID2Q9UJV3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MID2Q9UJV3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MID2Q9UJV3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MID2Q9UJV3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MID2Q9UJV3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MID2Q9UJV3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MID2Q9UJV3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MID2Q9UJV3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MID2Q9UJV3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MID2Q9UJV3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MID2Q9UJV3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MID2Q9UJV3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MID2Q9UJV3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MID2Q9UJV3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MID2Q9UJV3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MID2Q9UJV3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MID2Q9UJV3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MID2Q9UJV3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MID2Q9UJV3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MID2Q9UJV3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MID2Q9UJV3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MID2Q9UJV3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MID2Q9UJV3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MID2Q9UJV3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MID2Q9UJV3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MID2Q9UJV3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MID2Q9UJV3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MID2Q9UJV3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MID2Q9UJV3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MID2Q9UJV3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MID2Q9UJV3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MID2Q9UJV3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MID2Q9UJV3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MID2Q9UJV3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MID2Q9UJV3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MID2Q9UJV3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.7 ms