Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJP4

KLHL21, Kelch-like protein 21, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL21Q9UJP4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL21Q9UJP4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL21Q9UJP4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL21Q9UJP4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL21Q9UJP4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL21Q9UJP4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL21Q9UJP4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL21Q9UJP4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL21Q9UJP4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL21Q9UJP4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL21Q9UJP4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL21Q9UJP4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL21Q9UJP4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL21Q9UJP4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL21Q9UJP4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL21Q9UJP4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL21Q9UJP4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL21Q9UJP4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL21Q9UJP4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL21Q9UJP4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL21Q9UJP4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL21Q9UJP4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL21Q9UJP4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL21Q9UJP4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL21Q9UJP4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL21Q9UJP4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL21Q9UJP4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL21Q9UJP4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL21Q9UJP4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL21Q9UJP4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL21Q9UJP4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL21Q9UJP4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL21Q9UJP4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL21Q9UJP4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL21Q9UJP4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL21Q9UJP4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL21Q9UJP4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL21Q9UJP4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL21Q9UJP4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL21Q9UJP4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL21Q9UJP4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL21Q9UJP4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL21Q9UJP4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL21Q9UJP4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL21Q9UJP4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL21Q9UJP4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL21Q9UJP4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL21Q9UJP4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL21Q9UJP4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL21Q9UJP4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL21Q9UJP4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL21Q9UJP4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL21Q9UJP4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL21Q9UJP4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL21Q9UJP4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL21Q9UJP4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL21Q9UJP4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL21Q9UJP4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL21Q9UJP4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL21Q9UJP4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL21Q9UJP4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL21Q9UJP4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL21Q9UJP4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL21Q9UJP4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL21Q9UJP4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL21Q9UJP4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL21Q9UJP4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL21Q9UJP4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL21Q9UJP4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL21Q9UJP4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL21Q9UJP4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL21Q9UJP4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL21Q9UJP4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL21Q9UJP4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL21Q9UJP4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL21Q9UJP4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL21Q9UJP4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL21Q9UJP4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL21Q9UJP4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL21Q9UJP4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL21Q9UJP4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL21Q9UJP4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL21Q9UJP4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL21Q9UJP4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL21Q9UJP4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL21Q9UJP4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL21Q9UJP4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL21Q9UJP4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL21Q9UJP4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL21Q9UJP4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL21Q9UJP4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL21Q9UJP4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL21Q9UJP4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL21Q9UJP4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL21Q9UJP4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL21Q9UJP4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL21Q9UJP4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL21Q9UJP4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL21Q9UJP4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL21Q9UJP4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms