Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCDH10Q9P2E7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCDH10Q9P2E7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCDH10Q9P2E7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCDH10Q9P2E7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCDH10Q9P2E7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCDH10Q9P2E7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCDH10Q9P2E7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCDH10Q9P2E7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PCDH10Q9P2E7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PCDH10Q9P2E7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCDH10Q9P2E7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCDH10Q9P2E7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCDH10Q9P2E7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PCDH10Q9P2E7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCDH10Q9P2E7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCDH10Q9P2E7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCDH10Q9P2E7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCDH10Q9P2E7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCDH10Q9P2E7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PCDH10Q9P2E7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCDH10Q9P2E7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCDH10Q9P2E7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCDH10Q9P2E7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCDH10Q9P2E7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCDH10Q9P2E7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCDH10Q9P2E7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PCDH10Q9P2E7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCDH10Q9P2E7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCDH10Q9P2E7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCDH10Q9P2E7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCDH10Q9P2E7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCDH10Q9P2E7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCDH10Q9P2E7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCDH10Q9P2E7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PCDH10Q9P2E7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCDH10Q9P2E7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCDH10Q9P2E7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCDH10Q9P2E7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCDH10Q9P2E7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCDH10Q9P2E7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PCDH10Q9P2E7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PCDH10Q9P2E7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCDH10Q9P2E7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PCDH10Q9P2E7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PCDH10Q9P2E7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PCDH10Q9P2E7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PCDH10Q9P2E7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PCDH10Q9P2E7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PCDH10Q9P2E7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PCDH10Q9P2E7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PCDH10Q9P2E7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PCDH10Q9P2E7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PCDH10Q9P2E7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PCDH10Q9P2E7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PCDH10Q9P2E7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PCDH10Q9P2E7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PCDH10Q9P2E7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PCDH10Q9P2E7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PCDH10Q9P2E7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PCDH10Q9P2E7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PCDH10Q9P2E7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PCDH10Q9P2E7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PCDH10Q9P2E7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PCDH10Q9P2E7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCDH10Q9P2E7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCDH10Q9P2E7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCDH10Q9P2E7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCDH10Q9P2E7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCDH10Q9P2E7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PCDH10Q9P2E7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PCDH10Q9P2E7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PCDH10Q9P2E7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PCDH10Q9P2E7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PCDH10Q9P2E7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PCDH10Q9P2E7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCDH10Q9P2E7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCDH10Q9P2E7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCDH10Q9P2E7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCDH10Q9P2E7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCDH10Q9P2E7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCDH10Q9P2E7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCDH10Q9P2E7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PCDH10Q9P2E7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCDH10Q9P2E7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCDH10Q9P2E7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PCDH10Q9P2E7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCDH10Q9P2E7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCDH10Q9P2E7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDH10Q9P2E7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDH10Q9P2E7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDH10Q9P2E7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDH10Q9P2E7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
PCDH10Q9P2E7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDH10Q9P2E7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDH10Q9P2E7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDH10Q9P2E7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDH10Q9P2E7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDH10Q9P2E7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDH10Q9P2E7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms