Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U1

ACTR3B, Actin-related protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3BQ9P1U1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTR3BQ9P1U1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTR3BQ9P1U1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTR3BQ9P1U1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTR3BQ9P1U1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTR3BQ9P1U1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTR3BQ9P1U1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTR3BQ9P1U1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTR3BQ9P1U1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTR3BQ9P1U1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTR3BQ9P1U1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTR3BQ9P1U1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTR3BQ9P1U1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACTR3BQ9P1U1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACTR3BQ9P1U1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACTR3BQ9P1U1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACTR3BQ9P1U1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTR3BQ9P1U1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTR3BQ9P1U1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTR3BQ9P1U1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTR3BQ9P1U1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTR3BQ9P1U1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTR3BQ9P1U1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTR3BQ9P1U1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTR3BQ9P1U1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTR3BQ9P1U1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTR3BQ9P1U1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTR3BQ9P1U1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTR3BQ9P1U1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTR3BQ9P1U1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTR3BQ9P1U1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTR3BQ9P1U1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTR3BQ9P1U1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTR3BQ9P1U1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTR3BQ9P1U1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTR3BQ9P1U1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTR3BQ9P1U1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTR3BQ9P1U1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTR3BQ9P1U1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTR3BQ9P1U1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTR3BQ9P1U1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTR3BQ9P1U1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTR3BQ9P1U1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTR3BQ9P1U1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTR3BQ9P1U1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTR3BQ9P1U1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTR3BQ9P1U1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTR3BQ9P1U1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTR3BQ9P1U1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTR3BQ9P1U1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTR3BQ9P1U1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTR3BQ9P1U1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTR3BQ9P1U1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTR3BQ9P1U1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ACTR3BQ9P1U1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
ACTR3BQ9P1U1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTR3BQ9P1U1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTR3BQ9P1U1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTR3BQ9P1U1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTR3BQ9P1U1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTR3BQ9P1U1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTR3BQ9P1U1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTR3BQ9P1U1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTR3BQ9P1U1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTR3BQ9P1U1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTR3BQ9P1U1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTR3BQ9P1U1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTR3BQ9P1U1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTR3BQ9P1U1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTR3BQ9P1U1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTR3BQ9P1U1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTR3BQ9P1U1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTR3BQ9P1U1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTR3BQ9P1U1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTR3BQ9P1U1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTR3BQ9P1U1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ACTR3BQ9P1U1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTR3BQ9P1U1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTR3BQ9P1U1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTR3BQ9P1U1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTR3BQ9P1U1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTR3BQ9P1U1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTR3BQ9P1U1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTR3BQ9P1U1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTR3BQ9P1U1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTR3BQ9P1U1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTR3BQ9P1U1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTR3BQ9P1U1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTR3BQ9P1U1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTR3BQ9P1U1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTR3BQ9P1U1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTR3BQ9P1U1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTR3BQ9P1U1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTR3BQ9P1U1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTR3BQ9P1U1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTR3BQ9P1U1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTR3BQ9P1U1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTR3BQ9P1U1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTR3BQ9P1U1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTR3BQ9P1U1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms