Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHMP5Q9NZZ3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHMP5Q9NZZ3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHMP5Q9NZZ3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHMP5Q9NZZ3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHMP5Q9NZZ3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHMP5Q9NZZ3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHMP5Q9NZZ3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHMP5Q9NZZ3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CHMP5Q9NZZ3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CHMP5Q9NZZ3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CHMP5Q9NZZ3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CHMP5Q9NZZ3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHMP5Q9NZZ3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHMP5Q9NZZ3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHMP5Q9NZZ3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHMP5Q9NZZ3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CHMP5Q9NZZ3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CHMP5Q9NZZ3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CHMP5Q9NZZ3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CHMP5Q9NZZ3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CHMP5Q9NZZ3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CHMP5Q9NZZ3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CHMP5Q9NZZ3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CHMP5Q9NZZ3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CHMP5Q9NZZ3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CHMP5Q9NZZ3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHMP5Q9NZZ3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHMP5Q9NZZ3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHMP5Q9NZZ3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHMP5Q9NZZ3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHMP5Q9NZZ3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHMP5Q9NZZ3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHMP5Q9NZZ3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHMP5Q9NZZ3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHMP5Q9NZZ3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHMP5Q9NZZ3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHMP5Q9NZZ3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHMP5Q9NZZ3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHMP5Q9NZZ3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHMP5Q9NZZ3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHMP5Q9NZZ3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CHMP5Q9NZZ3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CHMP5Q9NZZ3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHMP5Q9NZZ3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHMP5Q9NZZ3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHMP5Q9NZZ3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHMP5Q9NZZ3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHMP5Q9NZZ3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHMP5Q9NZZ3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHMP5Q9NZZ3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHMP5Q9NZZ3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHMP5Q9NZZ3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHMP5Q9NZZ3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CHMP5Q9NZZ3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHMP5Q9NZZ3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHMP5Q9NZZ3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHMP5Q9NZZ3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHMP5Q9NZZ3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHMP5Q9NZZ3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHMP5Q9NZZ3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHMP5Q9NZZ3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHMP5Q9NZZ3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHMP5Q9NZZ3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHMP5Q9NZZ3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHMP5Q9NZZ3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHMP5Q9NZZ3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHMP5Q9NZZ3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHMP5Q9NZZ3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHMP5Q9NZZ3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHMP5Q9NZZ3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHMP5Q9NZZ3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHMP5Q9NZZ3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHMP5Q9NZZ3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHMP5Q9NZZ3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHMP5Q9NZZ3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CHMP5Q9NZZ3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHMP5Q9NZZ3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHMP5Q9NZZ3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHMP5Q9NZZ3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHMP5Q9NZZ3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHMP5Q9NZZ3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHMP5Q9NZZ3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHMP5Q9NZZ3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHMP5Q9NZZ3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHMP5Q9NZZ3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHMP5Q9NZZ3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHMP5Q9NZZ3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHMP5Q9NZZ3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHMP5Q9NZZ3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHMP5Q9NZZ3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHMP5Q9NZZ3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHMP5Q9NZZ3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHMP5Q9NZZ3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHMP5Q9NZZ3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHMP5Q9NZZ3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHMP5Q9NZZ3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHMP5Q9NZZ3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHMP5Q9NZZ3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHMP5Q9NZZ3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 233.1 ms