Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GDE1Q9NZC3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GDE1Q9NZC3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GDE1Q9NZC3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GDE1Q9NZC3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GDE1Q9NZC3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GDE1Q9NZC3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GDE1Q9NZC3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GDE1Q9NZC3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
GDE1Q9NZC3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GDE1Q9NZC3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GDE1Q9NZC3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GDE1Q9NZC3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GDE1Q9NZC3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GDE1Q9NZC3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GDE1Q9NZC3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GDE1Q9NZC3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GDE1Q9NZC3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GDE1Q9NZC3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GDE1Q9NZC3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
GDE1Q9NZC3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GDE1Q9NZC3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GDE1Q9NZC3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GDE1Q9NZC3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GDE1Q9NZC3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GDE1Q9NZC3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GDE1Q9NZC3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GDE1Q9NZC3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GDE1Q9NZC3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GDE1Q9NZC3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GDE1Q9NZC3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GDE1Q9NZC3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GDE1Q9NZC3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GDE1Q9NZC3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GDE1Q9NZC3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GDE1Q9NZC3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GDE1Q9NZC3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GDE1Q9NZC3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
GDE1Q9NZC3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GDE1Q9NZC3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GDE1Q9NZC3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GDE1Q9NZC3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GDE1Q9NZC3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GDE1Q9NZC3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GDE1Q9NZC3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GDE1Q9NZC3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GDE1Q9NZC3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GDE1Q9NZC3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GDE1Q9NZC3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GDE1Q9NZC3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GDE1Q9NZC3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GDE1Q9NZC3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GDE1Q9NZC3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GDE1Q9NZC3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GDE1Q9NZC3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GDE1Q9NZC3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GDE1Q9NZC3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GDE1Q9NZC3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GDE1Q9NZC3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GDE1Q9NZC3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GDE1Q9NZC3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GDE1Q9NZC3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GDE1Q9NZC3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GDE1Q9NZC3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GDE1Q9NZC3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GDE1Q9NZC3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GDE1Q9NZC3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GDE1Q9NZC3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GDE1Q9NZC3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GDE1Q9NZC3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GDE1Q9NZC3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GDE1Q9NZC3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GDE1Q9NZC3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GDE1Q9NZC3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GDE1Q9NZC3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GDE1Q9NZC3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GDE1Q9NZC3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GDE1Q9NZC3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GDE1Q9NZC3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GDE1Q9NZC3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GDE1Q9NZC3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GDE1Q9NZC3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GDE1Q9NZC3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GDE1Q9NZC3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GDE1Q9NZC3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GDE1Q9NZC3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GDE1Q9NZC3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GDE1Q9NZC3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GDE1Q9NZC3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GDE1Q9NZC3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GDE1Q9NZC3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GDE1Q9NZC3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GDE1Q9NZC3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GDE1Q9NZC3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GDE1Q9NZC3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GDE1Q9NZC3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GDE1Q9NZC3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GDE1Q9NZC3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GDE1Q9NZC3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GDE1Q9NZC3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
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