Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NKIRAS1Q9NYS0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NKIRAS1Q9NYS0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NKIRAS1Q9NYS0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NKIRAS1Q9NYS0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NKIRAS1Q9NYS0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NKIRAS1Q9NYS0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NKIRAS1Q9NYS0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NKIRAS1Q9NYS0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NKIRAS1Q9NYS0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NKIRAS1Q9NYS0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NKIRAS1Q9NYS0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NKIRAS1Q9NYS0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NKIRAS1Q9NYS0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NKIRAS1Q9NYS0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NKIRAS1Q9NYS0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NKIRAS1Q9NYS0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NKIRAS1Q9NYS0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NKIRAS1Q9NYS0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NKIRAS1Q9NYS0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NKIRAS1Q9NYS0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NKIRAS1Q9NYS0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NKIRAS1Q9NYS0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NKIRAS1Q9NYS0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NKIRAS1Q9NYS0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NKIRAS1Q9NYS0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NKIRAS1Q9NYS0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NKIRAS1Q9NYS0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NKIRAS1Q9NYS0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NKIRAS1Q9NYS0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NKIRAS1Q9NYS0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NKIRAS1Q9NYS0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NKIRAS1Q9NYS0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NKIRAS1Q9NYS0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NKIRAS1Q9NYS0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NKIRAS1Q9NYS0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NKIRAS1Q9NYS0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NKIRAS1Q9NYS0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NKIRAS1Q9NYS0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NKIRAS1Q9NYS0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NKIRAS1Q9NYS0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NKIRAS1Q9NYS0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NKIRAS1Q9NYS0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NKIRAS1Q9NYS0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NKIRAS1Q9NYS0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NKIRAS1Q9NYS0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NKIRAS1Q9NYS0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NKIRAS1Q9NYS0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NKIRAS1Q9NYS0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NKIRAS1Q9NYS0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NKIRAS1Q9NYS0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NKIRAS1Q9NYS0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NKIRAS1Q9NYS0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NKIRAS1Q9NYS0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NKIRAS1Q9NYS0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NKIRAS1Q9NYS0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NKIRAS1Q9NYS0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NKIRAS1Q9NYS0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NKIRAS1Q9NYS0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NKIRAS1Q9NYS0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NKIRAS1Q9NYS0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NKIRAS1Q9NYS0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NKIRAS1Q9NYS0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NKIRAS1Q9NYS0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NKIRAS1Q9NYS0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NKIRAS1Q9NYS0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NKIRAS1Q9NYS0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NKIRAS1Q9NYS0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NKIRAS1Q9NYS0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NKIRAS1Q9NYS0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NKIRAS1Q9NYS0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NKIRAS1Q9NYS0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NKIRAS1Q9NYS0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NKIRAS1Q9NYS0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NKIRAS1Q9NYS0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NKIRAS1Q9NYS0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NKIRAS1Q9NYS0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NKIRAS1Q9NYS0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NKIRAS1Q9NYS0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NKIRAS1Q9NYS0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NKIRAS1Q9NYS0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NKIRAS1Q9NYS0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NKIRAS1Q9NYS0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NKIRAS1Q9NYS0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NKIRAS1Q9NYS0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NKIRAS1Q9NYS0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NKIRAS1Q9NYS0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NKIRAS1Q9NYS0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NKIRAS1Q9NYS0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NKIRAS1Q9NYS0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NKIRAS1Q9NYS0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NKIRAS1Q9NYS0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NKIRAS1Q9NYS0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NKIRAS1Q9NYS0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NKIRAS1Q9NYS0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NKIRAS1Q9NYS0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NKIRAS1Q9NYS0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NKIRAS1Q9NYS0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NKIRAS1Q9NYS0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NKIRAS1Q9NYS0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms