Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY65

TUBA8, Tubulin alpha-8 chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA8Q9NY65 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBA8Q9NY65 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBA8Q9NY65 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBA8Q9NY65 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBA8Q9NY65 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBA8Q9NY65 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBA8Q9NY65 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBA8Q9NY65 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBA8Q9NY65 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBA8Q9NY65 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBA8Q9NY65 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBA8Q9NY65 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBA8Q9NY65 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TUBA8Q9NY65 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBA8Q9NY65 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBA8Q9NY65 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBA8Q9NY65 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBA8Q9NY65 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBA8Q9NY65 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBA8Q9NY65 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBA8Q9NY65 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBA8Q9NY65 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBA8Q9NY65 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBA8Q9NY65 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBA8Q9NY65 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBA8Q9NY65 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBA8Q9NY65 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBA8Q9NY65 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBA8Q9NY65 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBA8Q9NY65 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBA8Q9NY65 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBA8Q9NY65 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBA8Q9NY65 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBA8Q9NY65 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBA8Q9NY65 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBA8Q9NY65 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBA8Q9NY65 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBA8Q9NY65 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBA8Q9NY65 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBA8Q9NY65 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBA8Q9NY65 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBA8Q9NY65 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBA8Q9NY65 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBA8Q9NY65 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBA8Q9NY65 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBA8Q9NY65 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBA8Q9NY65 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBA8Q9NY65 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBA8Q9NY65 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBA8Q9NY65 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBA8Q9NY65 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBA8Q9NY65 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBA8Q9NY65 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBA8Q9NY65 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBA8Q9NY65 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBA8Q9NY65 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBA8Q9NY65 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBA8Q9NY65 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBA8Q9NY65 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBA8Q9NY65 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBA8Q9NY65 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBA8Q9NY65 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBA8Q9NY65 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBA8Q9NY65 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBA8Q9NY65 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBA8Q9NY65 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBA8Q9NY65 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBA8Q9NY65 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBA8Q9NY65 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBA8Q9NY65 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBA8Q9NY65 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TUBA8Q9NY65 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TUBA8Q9NY65 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TUBA8Q9NY65 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TUBA8Q9NY65 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBA8Q9NY65 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBA8Q9NY65 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBA8Q9NY65 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBA8Q9NY65 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBA8Q9NY65 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBA8Q9NY65 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBA8Q9NY65 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBA8Q9NY65 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBA8Q9NY65 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBA8Q9NY65 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBA8Q9NY65 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBA8Q9NY65 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBA8Q9NY65 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBA8Q9NY65 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBA8Q9NY65 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBA8Q9NY65 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBA8Q9NY65 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBA8Q9NY65 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBA8Q9NY65 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBA8Q9NY65 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBA8Q9NY65 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBA8Q9NY65 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBA8Q9NY65 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBA8Q9NY65 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBA8Q9NY65 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
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