Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR7

BABAM2, BRISC and BRCA1-A complex member 2, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BABAM2Q9NXR7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BABAM2Q9NXR7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BABAM2Q9NXR7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BABAM2Q9NXR7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BABAM2Q9NXR7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BABAM2Q9NXR7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BABAM2Q9NXR7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BABAM2Q9NXR7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BABAM2Q9NXR7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BABAM2Q9NXR7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BABAM2Q9NXR7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BABAM2Q9NXR7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BABAM2Q9NXR7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BABAM2Q9NXR7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BABAM2Q9NXR7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BABAM2Q9NXR7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BABAM2Q9NXR7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BABAM2Q9NXR7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BABAM2Q9NXR7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BABAM2Q9NXR7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BABAM2Q9NXR7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BABAM2Q9NXR7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BABAM2Q9NXR7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BABAM2Q9NXR7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BABAM2Q9NXR7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BABAM2Q9NXR7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BABAM2Q9NXR7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BABAM2Q9NXR7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BABAM2Q9NXR7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BABAM2Q9NXR7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BABAM2Q9NXR7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BABAM2Q9NXR7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BABAM2Q9NXR7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BABAM2Q9NXR7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BABAM2Q9NXR7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BABAM2Q9NXR7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BABAM2Q9NXR7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BABAM2Q9NXR7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BABAM2Q9NXR7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BABAM2Q9NXR7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BABAM2Q9NXR7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BABAM2Q9NXR7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BABAM2Q9NXR7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BABAM2Q9NXR7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BABAM2Q9NXR7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BABAM2Q9NXR7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BABAM2Q9NXR7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BABAM2Q9NXR7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BABAM2Q9NXR7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BABAM2Q9NXR7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BABAM2Q9NXR7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BABAM2Q9NXR7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BABAM2Q9NXR7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BABAM2Q9NXR7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BABAM2Q9NXR7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BABAM2Q9NXR7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BABAM2Q9NXR7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BABAM2Q9NXR7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BABAM2Q9NXR7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BABAM2Q9NXR7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BABAM2Q9NXR7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BABAM2Q9NXR7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BABAM2Q9NXR7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BABAM2Q9NXR7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BABAM2Q9NXR7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BABAM2Q9NXR7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BABAM2Q9NXR7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BABAM2Q9NXR7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BABAM2Q9NXR7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BABAM2Q9NXR7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BABAM2Q9NXR7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BABAM2Q9NXR7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BABAM2Q9NXR7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BABAM2Q9NXR7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BABAM2Q9NXR7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BABAM2Q9NXR7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BABAM2Q9NXR7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BABAM2Q9NXR7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BABAM2Q9NXR7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BABAM2Q9NXR7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BABAM2Q9NXR7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BABAM2Q9NXR7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BABAM2Q9NXR7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BABAM2Q9NXR7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BABAM2Q9NXR7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BABAM2Q9NXR7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BABAM2Q9NXR7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BABAM2Q9NXR7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BABAM2Q9NXR7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BABAM2Q9NXR7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BABAM2Q9NXR7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BABAM2Q9NXR7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BABAM2Q9NXR7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BABAM2Q9NXR7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BABAM2Q9NXR7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BABAM2Q9NXR7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BABAM2Q9NXR7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BABAM2Q9NXR7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BABAM2Q9NXR7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BABAM2Q9NXR7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms